202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4140 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_48020  putative L-malate dehydrogenase  94.91 
 
 		 334 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00543766  normal  0.806598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4140  putative L-malate dehydrogenase  100 
 
 		 334 aa  664    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1835  malate/L-lactate dehydrogenase  64.13 
 
 		 337 aa  447  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  62.24 
 
 		 336 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0565  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  62.16 
 
 		 344 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1423  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  61.86 
 
 		 344 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2191  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  61.86 
 
 		 344 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0467  malate/L-lactate dehydrogenase  62.16 
 
 		 344 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0876  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  61.86 
 
 		 344 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1882  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  61.49 
 
 		 346 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  60.66 
 
 		 344 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  60.06 
 
 		 340 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  60.36 
 
 		 340 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  59.76 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  59.76 
 
 		 340 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  59.76 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  58.86 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4028  malate/L-lactate dehydrogenase  59.46 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0113292  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3323  malate/L-lactate dehydrogenase  55.56 
 
 		 348 aa  371  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.115763 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  55.42 
 
 		 345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  55.56 
 
 		 343 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3870  malate/L-lactate dehydrogenase  57.37 
 
 		 345 aa  355  7.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6385  Malate/L-lactate dehydrogenase  55.31 
 
 		 344 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.738936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0941  malate/L-lactate dehydrogenase  54.98 
 
 		 344 aa  342  7e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4866  malate/L-lactate dehydrogenase  52.41 
 
 		 343 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.871504 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  49.55 
 
 		 356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0219  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  50.15 
 
 		 319 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  44.41 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  44.51 
 
 		 341 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2116  malate/L-lactate dehydrogenase  41.14 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  44.18 
 
 		 332 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  44.08 
 
 		 350 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  43.03 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  44.31 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  43.58 
 
 		 350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  42.9 
 
 		 343 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  42.11 
 
 		 343 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7014  malate dehydrogenase  38.14 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  36.56 
 
 		 344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  39.13 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  38.74 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  37.54 
 
 		 338 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5976  malate/L-lactate dehydrogenase  40.96 
 
 		 329 aa  192  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  39.12 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  43.89 
 
 		 329 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0890  malate dehydrogenase (NADP(+))  36.78 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.416405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3821  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.46 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  33.23 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.39 
 
 		 732 aa  155  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2141  malate/L-lactate dehydrogenase  32.63 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437506  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.95 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  32.53 
 
 		 348 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  31.12 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  31.12 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  31.12 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.2 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.74 
 
 		 331 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  32.92 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5101  malate/L-lactate dehydrogenase  35.2 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.540647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  33.92 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  29.38 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6359  malate/L-lactate dehydrogenase  33.53 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137633  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3293  malate/L-lactate dehydrogenase  33.63 
 
 		 360 aa  136  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769651  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4818  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.17 
 
 		 334 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.949996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.25 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  29.97 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  37.27 
 
 		 348 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  26.2 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  26.4 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  31.52 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.95 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.13 
 
 		 383 aa  125  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  29.38 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  33.75 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  31.9 
 
 		 369 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  31.9 
 
 		 369 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4858  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.64 
 
 		 333 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.169234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  31.27 
 
 		 375 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0783  hypothetical protein  31.54 
 
 		 369 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256957  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  31.54 
 
 		 369 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  34.96 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3802  malate/L-lactate dehydrogenase  35.05 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4858  hypothetical protein  29.38 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256767  hitchhiker  0.00905193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.27 
 
 		 364 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  30.97 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.64858 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  30.24 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  24.26 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.42 
 
 		 355 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  28.12 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.6 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.6 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  31.87 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  27.61 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3704  hypothetical protein  31.18 
 
 		 369 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305057  normal  0.776569 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  28.77 
 
 		 345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  32.67 
 
 		 350 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  28.35 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1122  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  26.57 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12130  malate dehydrogenase (NAD)  27.12 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.67 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>