201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3802 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3802  malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
343 aa  682    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  62.76 
 
 
352 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6359  malate/L-lactate dehydrogenase  64.18 
 
 
349 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.51 
 
 
349 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.01 
 
 
332 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.93 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  31.5 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  37.8 
 
 
349 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  37.01 
 
 
349 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  37.01 
 
 
349 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  39.32 
 
 
349 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.24 
 
 
355 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  33.13 
 
 
336 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  32.46 
 
 
351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.68 
 
 
331 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.83 
 
 
360 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.74 
 
 
353 aa  146  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  32.94 
 
 
351 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  36.48 
 
 
351 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  31.94 
 
 
361 aa  142  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  34.65 
 
 
333 aa  140  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.51 
 
 
364 aa  139  4.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.9 
 
 
359 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.89 
 
 
357 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.24 
 
 
329 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.45 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.97 
 
 
364 aa  136  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  28.24 
 
 
381 aa  137  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6385  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.58 
 
 
344 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.738936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  33.53 
 
 
343 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  27.91 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  32.36 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  30.86 
 
 
334 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.65 
 
 
356 aa  133  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  28.53 
 
 
347 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  30.41 
 
 
349 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  30.41 
 
 
349 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  30.41 
 
 
349 aa  132  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  30.41 
 
 
349 aa  132  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48020  putative L-malate dehydrogenase  32.34 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00543766  normal  0.806598 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  27.61 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5976  malate/L-lactate dehydrogenase  35.19 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  30.41 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1882  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  32.79 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.27 
 
 
361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  30.41 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  27.68 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  30.41 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  30.41 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  27.25 
 
 
358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4140  putative L-malate dehydrogenase  35.71 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.36 
 
 
334 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  29.64 
 
 
337 aa  129  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  32.92 
 
 
344 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  31.25 
 
 
365 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  31.34 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  34.47 
 
 
344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.56 
 
 
372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3870  malate/L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  31.21 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.82 
 
 
732 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  31.21 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  31.21 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  32.01 
 
 
343 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  29.39 
 
 
349 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.74 
 
 
338 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  28.37 
 
 
362 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  29.39 
 
 
349 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4866  malate/L-lactate dehydrogenase  34.81 
 
 
343 aa  126  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.871504 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0565  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  31.87 
 
 
344 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0467  malate/L-lactate dehydrogenase  31.87 
 
 
344 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  29.09 
 
 
349 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  29.09 
 
 
349 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1423  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  31.38 
 
 
344 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2191  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  31.38 
 
 
344 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7734  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0876  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  31.38 
 
 
344 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  32.06 
 
 
343 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  31.38 
 
 
339 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  32.67 
 
 
332 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1122  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  28.53 
 
 
328 aa  122  7e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  32.67 
 
 
341 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  27.19 
 
 
336 aa  122  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  26.75 
 
 
345 aa  122  8e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0941  malate/L-lactate dehydrogenase  33.03 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  32.88 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  30.93 
 
 
340 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  36.8 
 
 
356 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  32.2 
 
 
341 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  29.93 
 
 
350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.54 
 
 
350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  33.84 
 
 
350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  32.08 
 
 
340 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  31.36 
 
 
343 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  31.4 
 
 
340 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1835  malate/L-lactate dehydrogenase  31.15 
 
 
337 aa  119  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722064  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  34.21 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  28.46 
 
 
361 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  30.58 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  30.58 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  29.06 
 
 
340 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>