203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3591 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 351 aa  689    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  56.48 
 
 		 353 aa  361  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  38.76 
 
 		 361 aa  239  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  40.06 
 
 		 348 aa  229  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.55 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  40 
 
 		 336 aa  224  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.72 
 
 		 349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  37.24 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  42.17 
 
 		 360 aa  216  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  37.32 
 
 		 362 aa  216  7e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  38.58 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0618  Malate/L-lactate dehydrogenase  41.74 
 
 		 350 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.43 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.96 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.24 
 
 		 361 aa  193  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.75 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.93 
 
 		 359 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  33.33 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.72 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  36 
 
 		 353 aa  186  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  34.02 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  37.11 
 
 		 349 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  32.95 
 
 		 347 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  33.43 
 
 		 347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  37.11 
 
 		 349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  37.11 
 
 		 349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  35.73 
 
 		 351 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  34.38 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  36.01 
 
 		 337 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  33.03 
 
 		 335 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  33.03 
 
 		 335 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  33.03 
 
 		 335 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.43 
 
 		 357 aa  176  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.77 
 
 		 367 aa  175  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  35.86 
 
 		 349 aa  175  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  34.26 
 
 		 345 aa  175  9e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  32.34 
 
 		 336 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.63 
 
 		 732 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  35.43 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  35.63 
 
 		 375 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  34.37 
 
 		 361 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  32.39 
 
 		 362 aa  169  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  32.22 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  33.04 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  33.04 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  32.74 
 
 		 349 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4277  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.22 
 
 		 361 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  33.04 
 
 		 349 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  33.82 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  33.82 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  33.53 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  33.53 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  33.53 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  33.53 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  33.53 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  33.53 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  33.43 
 
 		 368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  32.91 
 
 		 345 aa  162  7e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0106  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  35.09 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1710  malate/L-lactate dehydrogenase  32.68 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.69 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  31.65 
 
 		 361 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.65 
 
 		 361 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  31.65 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  31.65 
 
 		 361 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  31.65 
 
 		 361 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  31.37 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12130  malate dehydrogenase (NAD)  30.56 
 
 		 369 aa  158  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  35.52 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3587  malate/L-lactate dehydrogenase  31.18 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.787615  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  32.88 
 
 		 364 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0241  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  36.19 
 
 		 345 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  31.65 
 
 		 361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  29.75 
 
 		 358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  31.65 
 
 		 361 aa  155  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.3 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  31.65 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.63 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1122  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  31.68 
 
 		 328 aa  152  8e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3968  hypothetical protein  33.72 
 
 		 364 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  33.14 
 
 		 350 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7014  malate dehydrogenase  30.68 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  34.49 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  31.68 
 
 		 364 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.55 
 
 		 350 aa  149  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  32.4 
 
 		 358 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1798  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.1 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  31.46 
 
 		 356 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0782  hypothetical protein  31.76 
 
 		 353 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  34 
 
 		 369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  30.32 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  33.71 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  33.71 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  33.71 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.63 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5976  malate/L-lactate dehydrogenase  38.17 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  36.07 
 
 		 352 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1400  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.36 
 
 		 362 aa  142  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  29.53 
 
 		 343 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>