201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1014 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
331 aa  638    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  79.33 
 
 
332 aa  512  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  39.4 
 
 
353 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  40 
 
 
352 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0941  malate/L-lactate dehydrogenase  38.3 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  39.09 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  40.06 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  36.42 
 
 
351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  45.25 
 
 
329 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.43 
 
 
334 aa  180  4e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 
349 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.88 
 
 
356 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0890  malate dehydrogenase (NADP(+))  39.27 
 
 
337 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.416405  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  35.31 
 
 
348 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6359  malate/L-lactate dehydrogenase  38.86 
 
 
349 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137633  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  35.76 
 
 
343 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  31.96 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  31.67 
 
 
349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  31.96 
 
 
349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  31.67 
 
 
349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5976  malate/L-lactate dehydrogenase  42.41 
 
 
329 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  38.96 
 
 
338 aa  168  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  34.57 
 
 
336 aa  168  9e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  36.25 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  37.88 
 
 
349 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  32.43 
 
 
349 aa  165  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  32.43 
 
 
349 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  33.66 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  33.66 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  32.43 
 
 
349 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  33.66 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  32.13 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4866  malate/L-lactate dehydrogenase  34.55 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.871504 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  37.82 
 
 
349 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  37.82 
 
 
349 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  32.13 
 
 
349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  31.83 
 
 
349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3821  Malate/L-lactate dehydrogenase  39.86 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  32.13 
 
 
349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  32.13 
 
 
349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  33.53 
 
 
344 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1122  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  34.2 
 
 
328 aa  161  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  35.21 
 
 
347 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  31.19 
 
 
347 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  36.73 
 
 
349 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6385  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 
344 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.738936 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  32.53 
 
 
345 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  35.45 
 
 
343 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  35.31 
 
 
340 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  35.31 
 
 
340 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  33.13 
 
 
336 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  31.19 
 
 
347 aa  156  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48020  putative L-malate dehydrogenase  33.74 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00543766  normal  0.806598 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 
345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  31.82 
 
 
361 aa  156  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3870  malate/L-lactate dehydrogenase  34.05 
 
 
345 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4140  putative L-malate dehydrogenase  33.74 
 
 
334 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  35 
 
 
340 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  32.54 
 
 
351 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  32.3 
 
 
336 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  34.85 
 
 
332 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  36.04 
 
 
350 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3802  malate/L-lactate dehydrogenase  36.68 
 
 
343 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  34.8 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  34.24 
 
 
356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.74 
 
 
350 aa  153  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  34.55 
 
 
341 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  35.65 
 
 
343 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  35.35 
 
 
340 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  36.53 
 
 
344 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4028  malate/L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 
340 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0113292  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  34.85 
 
 
341 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1835  malate/L-lactate dehydrogenase  33.54 
 
 
337 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722064  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7014  malate dehydrogenase  33.03 
 
 
349 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  35.31 
 
 
341 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  34.91 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1423  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  36.22 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2191  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  36.22 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7734  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0876  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  36.22 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0565  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  36.22 
 
 
344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0467  malate/L-lactate dehydrogenase  36.22 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  36.49 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  29.86 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 
340 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  28.33 
 
 
358 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2141  malate/L-lactate dehydrogenase  36.04 
 
 
328 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437506  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.8 
 
 
359 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0106  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.62 
 
 
346 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0971738  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.9 
 
 
364 aa  143  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.59 
 
 
353 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1882  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  36 
 
 
346 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0219  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  30.79 
 
 
319 aa  142  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3323  malate/L-lactate dehydrogenase  31.99 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.115763 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.43 
 
 
383 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  31.46 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.51 
 
 
355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.97 
 
 
344 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  32.97 
 
 
345 aa  137  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.77 
 
 
357 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  29.79 
 
 
362 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>