201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1882 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1423  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  98.84 
 
 		 344 aa  672    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1882  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  100 
 
 		 346 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  93.06 
 
 		 344 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2191  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  98.84 
 
 		 344 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7734  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0565  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  99.13 
 
 		 344 aa  674    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0467  malate/L-lactate dehydrogenase  98.84 
 
 		 344 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0876  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  98.84 
 
 		 344 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  85.71 
 
 		 340 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  85.71 
 
 		 340 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  86.27 
 
 		 340 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  84.52 
 
 		 340 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  85.12 
 
 		 340 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  84.23 
 
 		 340 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4028  malate/L-lactate dehydrogenase  83.63 
 
 		 340 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0113292  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  65.77 
 
 		 336 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48020  putative L-malate dehydrogenase  61.19 
 
 		 334 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00543766  normal  0.806598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4140  putative L-malate dehydrogenase  61.49 
 
 		 334 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1835  malate/L-lactate dehydrogenase  56.5 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3323  malate/L-lactate dehydrogenase  53.89 
 
 		 348 aa  362  6e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.115763 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  54.94 
 
 		 343 aa  334  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  54.21 
 
 		 345 aa  332  7.000000000000001e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3870  malate/L-lactate dehydrogenase  56.31 
 
 		 345 aa  331  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6385  Malate/L-lactate dehydrogenase  52.62 
 
 		 344 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.738936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0941  malate/L-lactate dehydrogenase  55.02 
 
 		 344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4866  malate/L-lactate dehydrogenase  52.17 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.871504 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  48.81 
 
 		 356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0219  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  48.29 
 
 		 319 aa  276  5e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  42.73 
 
 		 350 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  41.18 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  42.94 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  42.24 
 
 		 343 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  41.05 
 
 		 341 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  40.74 
 
 		 341 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  40.67 
 
 		 343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  40.06 
 
 		 341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  40.94 
 
 		 332 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  37.28 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2116  malate/L-lactate dehydrogenase  38.01 
 
 		 339 aa  205  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7014  malate dehydrogenase  39.52 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  43.65 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5976  malate/L-lactate dehydrogenase  41.27 
 
 		 329 aa  192  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  38.02 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  37.65 
 
 		 333 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  37.89 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.64 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3821  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.81 
 
 		 333 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0890  malate dehydrogenase (NADP(+))  35.67 
 
 		 337 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.416405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5101  malate/L-lactate dehydrogenase  37.22 
 
 		 331 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.540647 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  35.23 
 
 		 353 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  31.9 
 
 		 336 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.33 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.72 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2141  malate/L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 		 328 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437506  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  32.86 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  32.86 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  32.86 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.95 
 
 		 732 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  36 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  33.66 
 
 		 352 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  32 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6359  malate/L-lactate dehydrogenase  34.01 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137633  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  36.32 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  36.32 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  36.32 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  35.1 
 
 		 344 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.81 
 
 		 353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.37 
 
 		 360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  34.7 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  31.47 
 
 		 351 aa  126  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  31.79 
 
 		 348 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  29.94 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.43 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  35.98 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54834  dehydrogenase  35.79 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.286619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.62 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.35 
 
 		 364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  34.96 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  31.74 
 
 		 351 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4858  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.19 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.169234 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  36.1 
 
 		 369 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  36.1 
 
 		 369 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  36.1 
 
 		 369 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  36.1 
 
 		 369 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  34.17 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  33.11 
 
 		 358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3802  malate/L-lactate dehydrogenase  32.47 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  28.66 
 
 		 349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  35.19 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  28.66 
 
 		 349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  28.31 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  29.43 
 
 		 345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  28.66 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  116  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  33.33 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>