203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5976 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5976  malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 329 aa  619  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  75 
 
 		 329 aa  431  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  51.67 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  51.07 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  54.08 
 
 		 356 aa  295  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  46.22 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  45.51 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0890  malate dehydrogenase (NADP(+))  45.76 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.416405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3821  Malate/L-lactate dehydrogenase  48.12 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48020  putative L-malate dehydrogenase  42.17 
 
 		 334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00543766  normal  0.806598 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  39.09 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  41.21 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  39.09 
 
 		 340 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  39.09 
 
 		 340 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  39.39 
 
 		 340 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0565  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  41.21 
 
 		 344 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0467  malate/L-lactate dehydrogenase  41.21 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1423  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  40.91 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2191  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  40.91 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7734  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0876  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  40.91 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  38.48 
 
 		 340 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  38.97 
 
 		 336 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1882  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  41.27 
 
 		 346 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  40.61 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  37.88 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4028  malate/L-lactate dehydrogenase  37.58 
 
 		 340 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0113292  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  40.3 
 
 		 332 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  40.3 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  40.24 
 
 		 341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  37.69 
 
 		 343 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4140  putative L-malate dehydrogenase  40.96 
 
 		 334 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  42.54 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  40.69 
 
 		 350 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.71 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  41.12 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  39.1 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  37.88 
 
 		 343 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  39.69 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  37.8 
 
 		 343 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  37.05 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1835  malate/L-lactate dehydrogenase  36.98 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0941  malate/L-lactate dehydrogenase  40.69 
 
 		 344 aa  179  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7014  malate dehydrogenase  36.24 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4866  malate/L-lactate dehydrogenase  38.27 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.871504 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2116  malate/L-lactate dehydrogenase  37.74 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  42.41 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  33.85 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3870  malate/L-lactate dehydrogenase  36.93 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3323  malate/L-lactate dehydrogenase  34.88 
 
 		 348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.115763 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  34.65 
 
 		 349 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.55 
 
 		 349 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.55 
 
 		 349 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6385  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.22 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.738936 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5101  malate/L-lactate dehydrogenase  42.05 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.540647 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  36.02 
 
 		 353 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0219  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  34.34 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  35.52 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  34.49 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  34.21 
 
 		 348 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4858  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.22 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.169234 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  28.75 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  28.75 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  28.75 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  36.99 
 
 		 352 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4818  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.32 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.949996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6359  malate/L-lactate dehydrogenase  36.04 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137633  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  37.93 
 
 		 349 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  38.17 
 
 		 351 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2141  malate/L-lactate dehydrogenase  34.1 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437506  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  36.09 
 
 		 334 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  39.35 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  27.91 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.66 
 
 		 732 aa  135  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0241  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  35.53 
 
 		 345 aa  135  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  36.61 
 
 		 356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1122  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  29.01 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.99 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3802  malate/L-lactate dehydrogenase  34.23 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0106  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.8 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  36.65 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.4 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.4 
 
 		 355 aa  125  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  30.71 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  31.95 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.03 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  33.96 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  31.95 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  31.58 
 
 		 349 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.18 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  31.95 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  34.9 
 
 		 358 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  32.1 
 
 		 345 aa  123  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  31.85 
 
 		 351 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.73 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  28.66 
 
 		 349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  28.66 
 
 		 349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  28.35 
 
 		 349 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  28.44 
 
 		 349 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  31.67 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  28.35 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>