202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0591 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  98.85 
 
 		 349 aa  718    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  99.14 
 
 		 349 aa  723    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  98.85 
 
 		 349 aa  718    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  99.43 
 
 		 349 aa  723    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  87.39 
 
 		 349 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  87.11 
 
 		 349 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  87.68 
 
 		 349 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  87.39 
 
 		 349 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  100 
 
 		 349 aa  726    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  100 
 
 		 349 aa  726    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  99.14 
 
 		 349 aa  721    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  99.71 
 
 		 349 aa  725    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  40.61 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  40.61 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  40.61 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  40.43 
 
 		 336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.63 
 
 		 334 aa  242  7e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  35.6 
 
 		 336 aa  209  6e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  36.89 
 
 		 348 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.44 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.71 
 
 		 353 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  34.52 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.42 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.92 
 
 		 364 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  31.94 
 
 		 361 aa  182  9.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.39 
 
 		 360 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  31.64 
 
 		 345 aa  171  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.83 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  31.27 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  31.27 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  31.58 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  32.43 
 
 		 348 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  30.54 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.63 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  29.82 
 
 		 347 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2457  malate/L-lactate dehydrogenase  33.93 
 
 		 356 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  30.12 
 
 		 347 aa  159  9e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.43 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  33.01 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  31.64 
 
 		 375 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0618  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.93 
 
 		 350 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.91 
 
 		 355 aa  155  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.46 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  29.39 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.7 
 
 		 732 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.86 
 
 		 364 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  34.58 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  29.76 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.02 
 
 		 361 aa  143  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12130  malate dehydrogenase (NAD)  29.43 
 
 		 369 aa  142  6e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  29.49 
 
 		 376 aa  142  8e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.86 
 
 		 357 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  31.45 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  31.18 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.78 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  28.82 
 
 		 381 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3257  hypothetical protein  30.46 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236583  normal  0.244853 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0241  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  31.56 
 
 		 345 aa  136  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.03 
 
 		 356 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  28.28 
 
 		 362 aa  135  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  29 
 
 		 362 aa  133  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  30.25 
 
 		 343 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  34.41 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0106  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  29.46 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  29.41 
 
 		 361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  31.77 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  26.01 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.32 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  28.93 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  29.43 
 
 		 344 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.95 
 
 		 367 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  27.87 
 
 		 339 aa  129  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  31.55 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0890  malate dehydrogenase (NADP(+))  28.65 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.416405  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  29.13 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  29.13 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  29.13 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.13 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  29.13 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  29.13 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  29.13 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.07 
 
 		 350 aa  126  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  29.01 
 
 		 368 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  29.75 
 
 		 344 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  31.07 
 
 		 350 aa  125  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  27.63 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  27.63 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  27.63 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4866  malate/L-lactate dehydrogenase  32.26 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.871504 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  31.18 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  29.2 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  30.95 
 
 		 350 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3293  malate/L-lactate dehydrogenase  30.09 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769651  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  31.4 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3821  Malate/L-lactate dehydrogenase  30 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  27.33 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  27.63 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  29.12 
 
 		 336 aa  123  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  27.63 
 
 		 340 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>