202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5261 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
334 aa  652    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  54.49 
 
 
337 aa  328  7e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  55.41 
 
 
344 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0241  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  51.51 
 
 
345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0106  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  50.15 
 
 
346 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0971738  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  35.35 
 
 
345 aa  186  6e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.3 
 
 
349 aa  185  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  32.83 
 
 
347 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  32.52 
 
 
347 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1122  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  34.04 
 
 
328 aa  178  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  32.04 
 
 
345 aa  178  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  37.41 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  31.64 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  37.41 
 
 
349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  37.41 
 
 
349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  31.6 
 
 
335 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  31.6 
 
 
335 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  31.6 
 
 
335 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.7 
 
 
383 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  34.85 
 
 
351 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  34.52 
 
 
348 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.05 
 
 
364 aa  166  8e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.22 
 
 
367 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  34.28 
 
 
336 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.87 
 
 
353 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  34.49 
 
 
349 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  34.18 
 
 
348 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  34.2 
 
 
349 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  31.33 
 
 
351 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  31.2 
 
 
358 aa  157  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  33.91 
 
 
349 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  33.91 
 
 
349 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.68 
 
 
334 aa  156  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  34.2 
 
 
349 aa  156  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  34.2 
 
 
349 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  33.91 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  33.91 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  33.04 
 
 
349 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  32.74 
 
 
349 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  32.74 
 
 
349 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  32.74 
 
 
349 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  34.95 
 
 
349 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  36.25 
 
 
333 aa  153  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.37 
 
 
361 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.03 
 
 
355 aa  152  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.99 
 
 
353 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0618  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.49 
 
 
350 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.66 
 
 
356 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  32.24 
 
 
336 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  31.97 
 
 
361 aa  149  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.87 
 
 
329 aa  149  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.44 
 
 
360 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  33.33 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  33.43 
 
 
340 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  31.32 
 
 
361 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.69 
 
 
355 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  32.93 
 
 
343 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  36.23 
 
 
351 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  32.63 
 
 
338 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  32.83 
 
 
340 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  32.83 
 
 
340 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  32.83 
 
 
340 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  28.92 
 
 
336 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.46 
 
 
732 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  33.03 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  37.23 
 
 
343 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.86 
 
 
359 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.23 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 
375 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  31.72 
 
 
340 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  33.43 
 
 
350 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  32.23 
 
 
340 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.13 
 
 
350 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.23 
 
 
364 aa  139  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5976  malate/L-lactate dehydrogenase  36.09 
 
 
329 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4028  malate/L-lactate dehydrogenase  31.85 
 
 
340 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0113292  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0711  malate/L-lactate dehydrogenase  34.32 
 
 
355 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.707221  normal  0.854883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1601  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.91 
 
 
354 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  33.7 
 
 
341 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  33.62 
 
 
376 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.91 
 
 
372 aa  137  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  31.23 
 
 
368 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  29.9 
 
 
344 aa  136  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  33.1 
 
 
332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1423  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  33.03 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2191  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  33.03 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7734  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0876  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  33.03 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  29.09 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0565  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  33.03 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0467  malate/L-lactate dehydrogenase  33.03 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  32.16 
 
 
369 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  31.17 
 
 
356 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4858  hypothetical protein  32.16 
 
 
369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256767  hitchhiker  0.00905193 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4866  malate/L-lactate dehydrogenase  34.81 
 
 
343 aa  133  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.871504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.22 
 
 
332 aa  132  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.84 
 
 
353 aa  132  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  33.97 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  33.02 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  32.05 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  33.21 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>