201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2359 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  100 
 
 		 343 aa  688    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  91.25 
 
 		 343 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  74.56 
 
 		 343 aa  521  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  71.52 
 
 		 332 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  71.52 
 
 		 341 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  70.61 
 
 		 341 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  69.65 
 
 		 350 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  69.44 
 
 		 341 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  69.65 
 
 		 350 aa  464  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7014  malate dehydrogenase  57.83 
 
 		 349 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  44.44 
 
 		 343 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  42.06 
 
 		 340 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  42.06 
 
 		 340 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1835  malate/L-lactate dehydrogenase  41.72 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2116  malate/L-lactate dehydrogenase  40.3 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  41.47 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  40.99 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4028  malate/L-lactate dehydrogenase  41.27 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0113292  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  40.79 
 
 		 340 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  41.54 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48020  putative L-malate dehydrogenase  42.28 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00543766  normal  0.806598 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4866  malate/L-lactate dehydrogenase  42.48 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.871504 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  41.85 
 
 		 345 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0941  malate/L-lactate dehydrogenase  43.11 
 
 		 344 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  42.02 
 
 		 356 aa  222  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  40.41 
 
 		 340 aa  222  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1423  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  40.92 
 
 		 344 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2191  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  40.92 
 
 		 344 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7734  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0876  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  40.92 
 
 		 344 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0565  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  40.92 
 
 		 344 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0467  malate/L-lactate dehydrogenase  40.92 
 
 		 344 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3870  malate/L-lactate dehydrogenase  41.74 
 
 		 345 aa  219  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  40.62 
 
 		 344 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4140  putative L-malate dehydrogenase  42.11 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6385  Malate/L-lactate dehydrogenase  40.18 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.738936 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1882  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  40.67 
 
 		 346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3323  malate/L-lactate dehydrogenase  37.61 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.115763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  40 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  40.67 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  38.83 
 
 		 333 aa  189  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  37.65 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  41.4 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0219  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  38.77 
 
 		 319 aa  185  9e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  35.54 
 
 		 344 aa  182  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5976  malate/L-lactate dehydrogenase  42.41 
 
 		 329 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.33 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3821  Malate/L-lactate dehydrogenase  39.1 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0890  malate dehydrogenase (NADP(+))  35.28 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.416405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  30.68 
 
 		 351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  31.95 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  31.95 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  31.95 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  36.76 
 
 		 353 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  31.8 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  34.94 
 
 		 358 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  31.11 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.01 
 
 		 732 aa  152  8e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.24 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5101  malate/L-lactate dehydrogenase  39.39 
 
 		 331 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.540647 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  33.82 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1798  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.85 
 
 		 340 aa  146  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.73 
 
 		 332 aa  145  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2141  malate/L-lactate dehydrogenase  34.41 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437506  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1400  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.81 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.58 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  33.44 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  33.03 
 
 		 364 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  31.46 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  29.94 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.91 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1300  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.73 
 
 		 340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0783  hypothetical protein  31.46 
 
 		 369 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256957  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.16 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  30.25 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4858  hypothetical protein  31.46 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256767  hitchhiker  0.00905193 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  34.5 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  34.5 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  30.95 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  34.5 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  29.81 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  27.59 
 
 		 361 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  31.86 
 
 		 361 aa  133  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  32.29 
 
 		 350 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  32.26 
 
 		 356 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  31.27 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  31.3 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3704  hypothetical protein  32.51 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305057  normal  0.776569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.72 
 
 		 349 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.72 
 
 		 349 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.98 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3968  hypothetical protein  31.23 
 
 		 364 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.56 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0782  hypothetical protein  32.67 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  32.72 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  33.09 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  33.09 
 
 		 361 aa  126  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  32.72 
 
 		 361 aa  126  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.82 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  32.01 
 
 		 349 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.72 
 
 		 361 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>