203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1065 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 375 aa  764    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  42.74 
 
 		 367 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  39.66 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.66 
 
 		 364 aa  222  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.92 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  36.21 
 
 		 381 aa  217  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.28 
 
 		 361 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.53 
 
 		 364 aa  205  9e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.82 
 
 		 357 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.42 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  35.4 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.14 
 
 		 359 aa  199  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12130  malate dehydrogenase (NAD)  34.01 
 
 		 369 aa  196  5.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  32.48 
 
 		 376 aa  186  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  33.64 
 
 		 336 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  36.05 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2457  malate/L-lactate dehydrogenase  38.03 
 
 		 356 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.82 
 
 		 349 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.82 
 
 		 349 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  33.82 
 
 		 349 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  32.62 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  32.62 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  32.62 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.87 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  32.07 
 
 		 347 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.53 
 
 		 732 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  29.48 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  32.92 
 
 		 361 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  32.92 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  32.92 
 
 		 361 aa  169  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  32.92 
 
 		 361 aa  169  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  33.23 
 
 		 361 aa  170  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  32.92 
 
 		 361 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  32.92 
 
 		 361 aa  169  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0746 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.92 
 
 		 361 aa  169  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  32.92 
 
 		 361 aa  169  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.71 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  32.14 
 
 		 347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.58 
 
 		 355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  31.49 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.63 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  31.64 
 
 		 349 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  31.64 
 
 		 349 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  31.53 
 
 		 349 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  31.53 
 
 		 349 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  31.64 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  35.67 
 
 		 351 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  31.34 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  31.23 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  31.94 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  31.5 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  31.76 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  31.23 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  31.64 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  31.53 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  31.09 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  30.93 
 
 		 349 aa  160  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  31.72 
 
 		 349 aa  159  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  29.5 
 
 		 362 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.82 
 
 		 349 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0711  malate/L-lactate dehydrogenase  34.38 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.707221  normal  0.854883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1446  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.51 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0751418 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  31.53 
 
 		 345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  32.75 
 
 		 348 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  30.65 
 
 		 336 aa  152  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  31.07 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3839  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.43 
 
 		 362 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0537177  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  31.5 
 
 		 368 aa  149  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  31.4 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  31.07 
 
 		 361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  30 
 
 		 364 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  31.1 
 
 		 369 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  31.1 
 
 		 369 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  30.03 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1601  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.7 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4858  hypothetical protein  30.03 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256767  hitchhiker  0.00905193 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  28.01 
 
 		 353 aa  143  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5412  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.88 
 
 		 351 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.584123  hitchhiker  0.00277603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0042  malate/L-lactate dehydrogenase  30.09 
 
 		 349 aa  142  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  28.98 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  29.74 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  31.88 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0783  hypothetical protein  29.73 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256957  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  31.14 
 
 		 361 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5343  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.09 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0782  hypothetical protein  30.81 
 
 		 353 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  34.78 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  29.23 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.52 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3704  hypothetical protein  30.49 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305057  normal  0.776569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3968  hypothetical protein  31.23 
 
 		 364 aa  136  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4277  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.5 
 
 		 361 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  28.9 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3293  malate/L-lactate dehydrogenase  35.1 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769651  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3587  malate/L-lactate dehydrogenase  29.91 
 
 		 366 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.787615  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  30.87 
 
 		 344 aa  132  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1632  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.22 
 
 		 353 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000326891  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0618  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.65 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  28.86 
 
 		 350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.7 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>