202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4858 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3704  hypothetical protein  89.97 
 
 		 369 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305057  normal  0.776569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0783  hypothetical protein  95.93 
 
 		 369 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256957  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  93.77 
 
 		 369 aa  681    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  98.64 
 
 		 369 aa  738    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  93.5 
 
 		 369 aa  677    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  93.77 
 
 		 369 aa  681    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4858  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  748    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256767  hitchhiker  0.00905193 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  66.12 
 
 		 368 aa  494  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  68.27 
 
 		 367 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  61.71 
 
 		 362 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  55.24 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  54.96 
 
 		 361 aa  401  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  54.96 
 
 		 361 aa  401  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  54.96 
 
 		 361 aa  401  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  55.24 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  54.96 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  54.96 
 
 		 361 aa  401  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  55.24 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  54.96 
 
 		 361 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  53.78 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  53.78 
 
 		 364 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3968  hypothetical protein  49.86 
 
 		 364 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0782  hypothetical protein  49.43 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1300  Malate/L-lactate dehydrogenase  47.1 
 
 		 340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1400  Malate/L-lactate dehydrogenase  45.75 
 
 		 362 aa  270  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1798  Malate/L-lactate dehydrogenase  45.31 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1530  hypothetical protein  46.82 
 
 		 352 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2132  Malate/L-lactate dehydrogenase  43.34 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1632  Malate/L-lactate dehydrogenase  44.41 
 
 		 353 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000326891  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1601  Malate/L-lactate dehydrogenase  42.54 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1845  Malate/L-lactate dehydrogenase  42.61 
 
 		 355 aa  259  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.957462  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0711  malate/L-lactate dehydrogenase  45.38 
 
 		 355 aa  256  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.707221  normal  0.854883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  40.49 
 
 		 361 aa  255  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3587  malate/L-lactate dehydrogenase  39.78 
 
 		 366 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.787615  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  40 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  42.7 
 
 		 358 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1710  malate/L-lactate dehydrogenase  39.83 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4277  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.36 
 
 		 361 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  41.34 
 
 		 378 aa  235  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  40.11 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  40.13 
 
 		 350 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.93 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.62 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  33.04 
 
 		 343 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.24 
 
 		 367 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.12 
 
 		 349 aa  155  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  31.23 
 
 		 375 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  33.02 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.84 
 
 		 732 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  31.47 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.73 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  33.53 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.23 
 
 		 361 aa  145  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3548  malate/L-lactate dehydrogenase  30.75 
 
 		 358 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0039901  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  30.88 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  31.23 
 
 		 341 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.95 
 
 		 353 aa  142  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  32.47 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.65 
 
 		 364 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  30.66 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  29.46 
 
 		 345 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  37.55 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  32.74 
 
 		 345 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.61 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3870  malate/L-lactate dehydrogenase  32.93 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5343  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.05 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218988 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  32.94 
 
 		 356 aa  136  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.93 
 
 		 359 aa  135  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  31.46 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.15 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  32.81 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  31.03 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  31.48 
 
 		 353 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  31.03 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  32.38 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  31.12 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.21 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.25 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  30.2 
 
 		 340 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  28.73 
 
 		 381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  34.29 
 
 		 333 aa  133  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4538  malate/L-lactate dehydrogenase  30.66 
 
 		 354 aa  132  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.43 
 
 		 360 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  30.17 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3965  malate/L-lactate dehydrogenase  33.79 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  28.49 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2393  malate/L-lactate dehydrogenase  30.7 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5412  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.45 
 
 		 351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.584123  hitchhiker  0.00277603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  32.01 
 
 		 348 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  28.97 
 
 		 347 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  27.97 
 
 		 376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  34.3 
 
 		 334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7014  malate dehydrogenase  29.68 
 
 		 349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  29.77 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48020  putative L-malate dehydrogenase  29.38 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00543766  normal  0.806598 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  27.79 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  31.94 
 
 		 336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.02 
 
 		 329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  28.49 
 
 		 351 aa  126  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3972  malate/L-lactate dehydrogenase  30.03 
 
 		 353 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.901224  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>