202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3704 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0783  hypothetical protein  89.16 
 
 
369 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256957  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  88.77 
 
 
369 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  89.04 
 
 
369 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  89.43 
 
 
369 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  89.04 
 
 
369 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3704  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  743    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305057  normal  0.776569 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4858  hypothetical protein  89.97 
 
 
369 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256767  hitchhiker  0.00905193 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  65.65 
 
 
368 aa  484  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  66.58 
 
 
367 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  61.14 
 
 
362 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  54.96 
 
 
361 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  54.67 
 
 
361 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  54.67 
 
 
361 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  54.67 
 
 
361 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  54.67 
 
 
361 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  54.96 
 
 
361 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  54.67 
 
 
361 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  54.96 
 
 
361 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  54.67 
 
 
361 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  54.87 
 
 
364 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  54.14 
 
 
364 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3968  hypothetical protein  51.01 
 
 
364 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0782  hypothetical protein  51.4 
 
 
353 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1530  hypothetical protein  49 
 
 
352 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1300  Malate/L-lactate dehydrogenase  47.11 
 
 
340 aa  275  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1400  Malate/L-lactate dehydrogenase  47.06 
 
 
362 aa  275  8e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1798  Malate/L-lactate dehydrogenase  45.95 
 
 
340 aa  272  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2132  Malate/L-lactate dehydrogenase  43.63 
 
 
355 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1845  Malate/L-lactate dehydrogenase  42.33 
 
 
355 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.957462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  41.9 
 
 
361 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1601  Malate/L-lactate dehydrogenase  42.37 
 
 
354 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0711  malate/L-lactate dehydrogenase  45.69 
 
 
355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.707221  normal  0.854883 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1632  Malate/L-lactate dehydrogenase  43.87 
 
 
353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000326891  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3587  malate/L-lactate dehydrogenase  41.03 
 
 
366 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.787615  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1710  malate/L-lactate dehydrogenase  40.5 
 
 
361 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4277  Malate/L-lactate dehydrogenase  39.51 
 
 
361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  42.74 
 
 
378 aa  242  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  43.71 
 
 
358 aa  242  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  40.06 
 
 
361 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  42.15 
 
 
356 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  38.79 
 
 
350 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.63 
 
 
353 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.03 
 
 
349 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  33.63 
 
 
343 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.39 
 
 
732 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.46 
 
 
350 aa  153  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  33.81 
 
 
350 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  34.69 
 
 
343 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.99 
 
 
355 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.04 
 
 
367 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  30.79 
 
 
375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.09 
 
 
345 aa  145  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  32.04 
 
 
348 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.41 
 
 
334 aa  139  6e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.62 
 
 
364 aa  139  7e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.14 
 
 
353 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  32.57 
 
 
341 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.57 
 
 
360 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.27 
 
 
359 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  29.8 
 
 
341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5343  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.45 
 
 
353 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.46 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.62 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  30.18 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  30.09 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3548  malate/L-lactate dehydrogenase  28.53 
 
 
358 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0039901  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4538  malate/L-lactate dehydrogenase  30.55 
 
 
354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  30.92 
 
 
351 aa  133  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  32.51 
 
 
343 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  36.77 
 
 
339 aa  133  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  31.56 
 
 
345 aa  132  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  28.93 
 
 
381 aa  132  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3870  malate/L-lactate dehydrogenase  32.13 
 
 
345 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.08 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2393  malate/L-lactate dehydrogenase  31.43 
 
 
354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  31.94 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.46 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  29.19 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  33.33 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  32.18 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  27.79 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  29 
 
 
345 aa  130  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  27.79 
 
 
347 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  31.68 
 
 
353 aa  129  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  30.59 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  33.86 
 
 
333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  32.54 
 
 
356 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.44 
 
 
329 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  32.52 
 
 
334 aa  127  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3965  malate/L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 
354 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  27.89 
 
 
335 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  27.89 
 
 
335 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  27.89 
 
 
335 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  27.22 
 
 
347 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  32.46 
 
 
344 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.08 
 
 
383 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  30.03 
 
 
340 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  31.09 
 
 
340 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  31.09 
 
 
340 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5412  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.15 
 
 
351 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.584123  hitchhiker  0.00277603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>