201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3965 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3965  malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 354 aa  721    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4538  malate/L-lactate dehydrogenase  50.14 
 
 		 354 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2393  malate/L-lactate dehydrogenase  49.71 
 
 		 354 aa  342  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2575  Malate/L-lactate dehydrogenase  46.96 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3548  malate/L-lactate dehydrogenase  46.06 
 
 		 358 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0039901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3972  malate/L-lactate dehydrogenase  44.25 
 
 		 353 aa  290  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.901224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2854  malate/L-lactate dehydrogenase  44.88 
 
 		 352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.803203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2947  malate/L-lactate dehydrogenase  44.38 
 
 		 352 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.353737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2835  Ldh family oxidoreductase  45.59 
 
 		 344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.129302  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1752  malate/L-lactate dehydrogenase  44.74 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.516121  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5343  Malate/L-lactate dehydrogenase  42.77 
 
 		 353 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0042  malate/L-lactate dehydrogenase  38.26 
 
 		 349 aa  272  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5412  Malate/L-lactate dehydrogenase  43.64 
 
 		 351 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.584123  hitchhiker  0.00277603 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.7 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  29.46 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  29.46 
 
 		 361 aa  143  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  29.17 
 
 		 361 aa  142  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  28.87 
 
 		 361 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.87 
 
 		 361 aa  139  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  28.87 
 
 		 361 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  28.87 
 
 		 361 aa  139  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  28.87 
 
 		 361 aa  139  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  28.87 
 
 		 361 aa  139  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  34.3 
 
 		 350 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  31.5 
 
 		 368 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.72 
 
 		 732 aa  139  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  30.29 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  29.67 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  34.48 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1798  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.91 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  32.53 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0711  malate/L-lactate dehydrogenase  30.47 
 
 		 355 aa  130  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.707221  normal  0.854883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1400  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.2 
 
 		 362 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4858  hypothetical protein  34.14 
 
 		 369 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256767  hitchhiker  0.00905193 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  28.37 
 
 		 362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  33.45 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  33.45 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  32.3 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1446  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.43 
 
 		 377 aa  125  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0751418 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.22 
 
 		 364 aa  125  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0783  hypothetical protein  33.45 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256957  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.02 
 
 		 353 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  28.96 
 
 		 365 aa  122  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.82 
 
 		 349 aa  122  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  29.5 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  29.5 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  29.5 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  29.79 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3704  hypothetical protein  32.15 
 
 		 369 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305057  normal  0.776569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  28.96 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  31.58 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.04 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  30.56 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  31.8 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.81 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.89 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.89 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  28.78 
 
 		 364 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  26.89 
 
 		 351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  27.08 
 
 		 345 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  31.19 
 
 		 349 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  27.93 
 
 		 347 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  30.24 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0782  hypothetical protein  29.71 
 
 		 353 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  28.11 
 
 		 347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  29.01 
 
 		 352 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  31.42 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.62 
 
 		 383 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  29.28 
 
 		 358 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  30.7 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  26.61 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0576  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.66 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.939938  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  27.09 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  27.4 
 
 		 348 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6359  malate/L-lactate dehydrogenase  28.96 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137633  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.65 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.53 
 
 		 360 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  30.66 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  36.29 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  24.04 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  29.84 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.87 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  26.75 
 
 		 336 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1300  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.01 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1530  hypothetical protein  30.38 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  25.7 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1632  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.97 
 
 		 353 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000326891  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  28.79 
 
 		 332 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  29.15 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3968  hypothetical protein  28.45 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  28.9 
 
 		 356 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  28.07 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.07 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  28.4 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  28.78 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.05 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  25.97 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3587  malate/L-lactate dehydrogenase  26.75 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.787615  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1601  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.05 
 
 		 354 aa  99.8  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1710  malate/L-lactate dehydrogenase  27.6 
 
 		 361 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>