201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2393 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2393  malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 354 aa  711    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4538  malate/L-lactate dehydrogenase  65.24 
 
 		 354 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2575  Malate/L-lactate dehydrogenase  53.18 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3965  malate/L-lactate dehydrogenase  49.71 
 
 		 354 aa  342  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3548  malate/L-lactate dehydrogenase  46.11 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0039901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3972  malate/L-lactate dehydrogenase  46.89 
 
 		 353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.901224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5343  Malate/L-lactate dehydrogenase  44.12 
 
 		 353 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218988 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5412  Malate/L-lactate dehydrogenase  43.4 
 
 		 351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.584123  hitchhiker  0.00277603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2854  malate/L-lactate dehydrogenase  43.1 
 
 		 352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.803203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2947  malate/L-lactate dehydrogenase  42.82 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.353737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2835  Ldh family oxidoreductase  43.92 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.129302  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0042  malate/L-lactate dehydrogenase  37.28 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1752  malate/L-lactate dehydrogenase  39.35 
 
 		 355 aa  226  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.516121  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.01 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  29.27 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0782  hypothetical protein  30.7 
 
 		 353 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.78 
 
 		 732 aa  133  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  29.17 
 
 		 364 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  30.25 
 
 		 356 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  30.38 
 
 		 369 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0711  malate/L-lactate dehydrogenase  30 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.707221  normal  0.854883 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  29.62 
 
 		 350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1632  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.14 
 
 		 353 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000326891  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4858  hypothetical protein  30.06 
 
 		 369 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256767  hitchhiker  0.00905193 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1601  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.45 
 
 		 354 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  28.33 
 
 		 369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  28.33 
 
 		 369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0783  hypothetical protein  30.95 
 
 		 369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256957  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1530  hypothetical protein  30.58 
 
 		 352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  26.94 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  26.67 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  26.67 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.67 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  26.67 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  26.67 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.11 
 
 		 353 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  26.67 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  26.67 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  26.87 
 
 		 362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1798  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.58 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  33.03 
 
 		 337 aa  126  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  27.27 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  26.69 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3968  hypothetical protein  28.95 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3704  hypothetical protein  30.56 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305057  normal  0.776569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  30.16 
 
 		 369 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1446  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.53 
 
 		 377 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0751418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  29.88 
 
 		 358 aa  123  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  29.14 
 
 		 361 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1400  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.74 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.18 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  29.88 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.97 
 
 		 349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6359  malate/L-lactate dehydrogenase  31.17 
 
 		 349 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137633  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  31.08 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  28.33 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  28.16 
 
 		 351 aa  119  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  28.53 
 
 		 336 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  27.89 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3587  malate/L-lactate dehydrogenase  27.12 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.787615  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.9 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.9 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1845  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.34 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.957462  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  30.33 
 
 		 352 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  28.73 
 
 		 361 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2132  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.3 
 
 		 355 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  27.4 
 
 		 348 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  27.15 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1710  malate/L-lactate dehydrogenase  27.4 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  29.82 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.84 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.99 
 
 		 364 aa  110  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  25 
 
 		 376 aa  109  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  25.77 
 
 		 351 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  29.97 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4277  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.12 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1300  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.95 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.53 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0106  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  29.35 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  23.94 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  29.67 
 
 		 344 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  26.52 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  25 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  27.49 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  27.49 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  30.2 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  28.4 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  27.69 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  27.83 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  27.86 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  25 
 
 		 347 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4028  malate/L-lactate dehydrogenase  29.62 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0113292  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.63 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  28.03 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4866  malate/L-lactate dehydrogenase  30.23 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.871504 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  24.85 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4140  putative L-malate dehydrogenase  29.1 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  29.27 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48020  putative L-malate dehydrogenase  28.49 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00543766  normal  0.806598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>