202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1752 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1752  malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
355 aa  709    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.516121  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2947  malate/L-lactate dehydrogenase  54.68 
 
 
352 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.353737  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2854  malate/L-lactate dehydrogenase  53.96 
 
 
352 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.803203  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2835  Ldh family oxidoreductase  54.19 
 
 
344 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.129302  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3965  malate/L-lactate dehydrogenase  44.74 
 
 
354 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2575  Malate/L-lactate dehydrogenase  39.58 
 
 
355 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4538  malate/L-lactate dehydrogenase  41.04 
 
 
354 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3548  malate/L-lactate dehydrogenase  41.89 
 
 
358 aa  242  9e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0039901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3972  malate/L-lactate dehydrogenase  41.64 
 
 
353 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.901224  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2393  malate/L-lactate dehydrogenase  39.35 
 
 
354 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5343  Malate/L-lactate dehydrogenase  39.22 
 
 
353 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218988 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5412  Malate/L-lactate dehydrogenase  39.52 
 
 
351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.584123  hitchhiker  0.00277603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0042  malate/L-lactate dehydrogenase  31.98 
 
 
349 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.74 
 
 
353 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  29.52 
 
 
345 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.58 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  31.16 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.36 
 
 
350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  31.2 
 
 
343 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0711  malate/L-lactate dehydrogenase  31 
 
 
355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.707221  normal  0.854883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  27.6 
 
 
335 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  27.6 
 
 
335 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  27.6 
 
 
335 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  29.03 
 
 
347 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.89 
 
 
353 aa  116  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  29.03 
 
 
347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  28.29 
 
 
369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  29.03 
 
 
347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.16 
 
 
349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1798  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.18 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.32 
 
 
732 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.24 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4858  hypothetical protein  27.73 
 
 
369 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256767  hitchhiker  0.00905193 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  24 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  25.94 
 
 
361 aa  109  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  30.03 
 
 
334 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.85901 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  25.28 
 
 
361 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.28 
 
 
361 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.21 
 
 
378 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  25.28 
 
 
361 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  25.28 
 
 
361 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  25.28 
 
 
361 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  25.28 
 
 
361 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  25.48 
 
 
362 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  25.28 
 
 
361 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  25.28 
 
 
361 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  25.28 
 
 
361 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  26.97 
 
 
369 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  26.97 
 
 
369 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  30.72 
 
 
343 aa  106  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  28.15 
 
 
356 aa  106  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  28.16 
 
 
332 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  30.95 
 
 
343 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0783  hypothetical protein  27.25 
 
 
369 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256957  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  25.49 
 
 
368 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  27.11 
 
 
364 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  26.16 
 
 
361 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1400  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.88 
 
 
362 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  29 
 
 
351 aa  103  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  28.16 
 
 
341 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  25.5 
 
 
336 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  27.43 
 
 
364 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  27.3 
 
 
341 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0890  malate dehydrogenase (NADP(+))  32.92 
 
 
337 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.416405  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  27.54 
 
 
369 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  29.14 
 
 
337 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  23.81 
 
 
351 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  29.81 
 
 
333 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  29.55 
 
 
358 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  25.55 
 
 
361 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  28.79 
 
 
348 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  27.56 
 
 
345 aa  99.8  6e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3704  hypothetical protein  26.63 
 
 
369 aa  99.4  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305057  normal  0.776569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3889  2,3-diketo-L-gulonate reductase  26.21 
 
 
332 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  24.48 
 
 
376 aa  97.8  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3821  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.64 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4277  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.46 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  28.75 
 
 
350 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  28.29 
 
 
356 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3692  2,3-diketo-L-gulonate reductase  25.89 
 
 
332 aa  96.7  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  27.73 
 
 
336 aa  96.3  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1446  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.86 
 
 
377 aa  96.3  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0751418 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  26.81 
 
 
343 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  27.86 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  27.86 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  28.15 
 
 
349 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3587  malate/L-lactate dehydrogenase  27.03 
 
 
366 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.787615  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  28.31 
 
 
341 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1710  malate/L-lactate dehydrogenase  26.57 
 
 
361 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3933  2,3-diketo-L-gulonate reductase  25.83 
 
 
332 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  27.86 
 
 
339 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  26.7 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.49 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1300  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.81 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.35 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  26.21 
 
 
365 aa  90.1  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.83 
 
 
329 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.41 
 
 
357 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.91 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1835  malate/L-lactate dehydrogenase  26.99 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722064  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>