202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3972 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3972  malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 353 aa  714    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.901224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0042  malate/L-lactate dehydrogenase  46.29 
 
 		 349 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4538  malate/L-lactate dehydrogenase  47.41 
 
 		 354 aa  309  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2393  malate/L-lactate dehydrogenase  46.89 
 
 		 354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5343  Malate/L-lactate dehydrogenase  47.34 
 
 		 353 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218988 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5412  Malate/L-lactate dehydrogenase  48.38 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.584123  hitchhiker  0.00277603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3965  malate/L-lactate dehydrogenase  44.25 
 
 		 354 aa  290  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2575  Malate/L-lactate dehydrogenase  46.46 
 
 		 355 aa  286  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3548  malate/L-lactate dehydrogenase  40.7 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0039901  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2854  malate/L-lactate dehydrogenase  41.04 
 
 		 352 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.803203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2835  Ldh family oxidoreductase  41.49 
 
 		 344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.129302  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2947  malate/L-lactate dehydrogenase  41.11 
 
 		 352 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.353737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1752  malate/L-lactate dehydrogenase  41.64 
 
 		 355 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.516121  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.16 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  31.46 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  30.31 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1446  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.05 
 
 		 377 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0751418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.63 
 
 		 378 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0711  malate/L-lactate dehydrogenase  30.14 
 
 		 355 aa  136  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.707221  normal  0.854883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  31.9 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  29.21 
 
 		 361 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  29.01 
 
 		 361 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  28.73 
 
 		 361 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  29.3 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.3 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  29.3 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  29.3 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  29.3 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  29.97 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  28.73 
 
 		 361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.35 
 
 		 372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  31.67 
 
 		 350 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.14 
 
 		 353 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1601  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.14 
 
 		 354 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  30.21 
 
 		 369 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 		 732 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3968  hypothetical protein  30.45 
 
 		 364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  29.39 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  29.91 
 
 		 369 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4858  hypothetical protein  30.03 
 
 		 369 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256767  hitchhiker  0.00905193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  28.9 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.03 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  29.62 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  29.62 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  28.33 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1300  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.5 
 
 		 340 aa  122  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  26.44 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1400  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.84 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1632  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.99 
 
 		 353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000326891  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  30 
 
 		 351 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1845  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.86 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.957462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0782  hypothetical protein  29.79 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0783  hypothetical protein  29.03 
 
 		 369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256957  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  29.33 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1530  hypothetical protein  28.86 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2132  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.22 
 
 		 355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1798  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.06 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  26.06 
 
 		 361 aa  113  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3704  hypothetical protein  30.21 
 
 		 369 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305057  normal  0.776569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.03 
 
 		 367 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  24.78 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  26.24 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  28.37 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  25.78 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  27.7 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4277  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.59 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  28.24 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  25.42 
 
 		 347 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.15 
 
 		 334 aa  109  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  28.96 
 
 		 336 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.35 
 
 		 383 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.4 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.54 
 
 		 349 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3587  malate/L-lactate dehydrogenase  27.62 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.787615  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  26.36 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  25.28 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  28.37 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  27.93 
 
 		 349 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  27.95 
 
 		 348 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.26 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1710  malate/L-lactate dehydrogenase  27.33 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  31.28 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  27.43 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  27.43 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  27.43 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6359  malate/L-lactate dehydrogenase  28.73 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137633  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  26.55 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.63 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  24.19 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4028  malate/L-lactate dehydrogenase  30.86 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0113292  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  28.57 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0576  Malate/L-lactate dehydrogenase  23.78 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.939938  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3802  malate/L-lactate dehydrogenase  28.81 
 
 		 343 aa  99.8  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  29.09 
 
 		 352 aa  99.4  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  29.19 
 
 		 343 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  26.74 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  26.74 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  28.02 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  27.89 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1835  malate/L-lactate dehydrogenase  26.7 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722064  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>