202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1632 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1632  Malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
353 aa  723    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000326891  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1601  Malate/L-lactate dehydrogenase  81.59 
 
 
354 aa  598  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1845  Malate/L-lactate dehydrogenase  72.52 
 
 
355 aa  533  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.957462  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2132  Malate/L-lactate dehydrogenase  71.95 
 
 
355 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0711  malate/L-lactate dehydrogenase  46.96 
 
 
355 aa  289  5.0000000000000004e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.707221  normal  0.854883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  45.53 
 
 
362 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  43.39 
 
 
361 aa  271  9e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  43.52 
 
 
361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  43.23 
 
 
361 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  43.23 
 
 
361 aa  269  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  42.94 
 
 
361 aa  269  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  43.23 
 
 
361 aa  269  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  43.23 
 
 
361 aa  269  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  43.23 
 
 
361 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  42.94 
 
 
361 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  45.27 
 
 
367 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  43.87 
 
 
368 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3968  hypothetical protein  46.42 
 
 
364 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1798  Malate/L-lactate dehydrogenase  43.65 
 
 
340 aa  260  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1400  Malate/L-lactate dehydrogenase  43.34 
 
 
362 aa  258  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  44.7 
 
 
369 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  44.6 
 
 
369 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  44.6 
 
 
369 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  44.6 
 
 
369 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4858  hypothetical protein  44.13 
 
 
369 aa  252  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256767  hitchhiker  0.00905193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0783  hypothetical protein  44.41 
 
 
369 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256957  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3704  hypothetical protein  43.02 
 
 
369 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305057  normal  0.776569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1300  Malate/L-lactate dehydrogenase  41.79 
 
 
340 aa  246  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0782  hypothetical protein  43.71 
 
 
353 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  41.62 
 
 
364 aa  239  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  41.33 
 
 
364 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  38.86 
 
 
350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  39.61 
 
 
378 aa  228  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  39.34 
 
 
358 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1530  hypothetical protein  42.24 
 
 
352 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  40 
 
 
356 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  35.49 
 
 
361 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.69 
 
 
353 aa  199  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1710  malate/L-lactate dehydrogenase  33.71 
 
 
361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  34.93 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3587  malate/L-lactate dehydrogenase  32.58 
 
 
366 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.787615  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4277  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.74 
 
 
361 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.2 
 
 
355 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.14 
 
 
372 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  31.34 
 
 
348 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.72 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  28.82 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  30.06 
 
 
349 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  29.76 
 
 
349 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  29.76 
 
 
349 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.78 
 
 
364 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  29.91 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0576  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.66 
 
 
337 aa  129  6e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.939938  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2393  malate/L-lactate dehydrogenase  31.14 
 
 
354 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  30.22 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.54 
 
 
350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  27.3 
 
 
332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  27.94 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  27.94 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  29.53 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  27.94 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  30.54 
 
 
350 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  27.78 
 
 
347 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1597  2,3-diketo-L-gulonate reductase  27.81 
 
 
334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0241  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  32.76 
 
 
345 aa  126  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  31.38 
 
 
349 aa  126  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4538  malate/L-lactate dehydrogenase  30.93 
 
 
354 aa  126  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.62 
 
 
334 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.19 
 
 
349 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.09 
 
 
361 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  27.01 
 
 
341 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  27.49 
 
 
347 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3889  2,3-diketo-L-gulonate reductase  26.76 
 
 
332 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3933  2,3-diketo-L-gulonate reductase  26.76 
 
 
332 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  26.86 
 
 
341 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3692  2,3-diketo-L-gulonate reductase  26.18 
 
 
332 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3866  2,3-diketo-L-gulonate reductase  25.88 
 
 
332 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3882  2,3-diketo-L-gulonate reductase  25.88 
 
 
332 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4053  2,3-diketo-L-gulonate reductase  25.88 
 
 
332 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.771616  normal  0.431121 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3991  2,3-diketo-L-gulonate reductase  25.88 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5343  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.74 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3972  malate/L-lactate dehydrogenase  28.99 
 
 
353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.901224  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3946  2,3-diketo-L-gulonate reductase  25.88 
 
 
332 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  28.13 
 
 
376 aa  119  7e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.69 
 
 
732 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0042  malate/L-lactate dehydrogenase  27.54 
 
 
349 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  31.58 
 
 
334 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  27.62 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  27.49 
 
 
347 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2575  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.82 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03427  2,3-diketo-L-gulonate dehydrogenase, NADH-dependent  25.29 
 
 
332 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0135  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.29 
 
 
332 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03378  hypothetical protein  25.29 
 
 
332 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0139  2,3-diketo-L-gulonate reductase  25.29 
 
 
332 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3779  2,3-diketo-L-gulonate reductase  25.29 
 
 
332 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  31.5 
 
 
344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  27.33 
 
 
343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3947  2,3-diketo-L-gulonate reductase  25.29 
 
 
329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  26.45 
 
 
358 aa  116  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.59 
 
 
357 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.366765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>