193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54834 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_54834  dehydrogenase  100 
 
 		 392 aa  800    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.286619  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29499  predicted protein  41.87 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.096211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  33.75 
 
 		 347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  34.3 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1835  malate/L-lactate dehydrogenase  33.03 
 
 		 337 aa  133  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  32.51 
 
 		 347 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  31.36 
 
 		 348 aa  130  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.7 
 
 		 332 aa  126  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  28.53 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  28.88 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  28.53 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  28.53 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.62 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 340 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  35.42 
 
 		 344 aa  123  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1423  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  35.79 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3293  malate/L-lactate dehydrogenase  31.19 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769651  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2191  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  35.79 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7734  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0876  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  35.79 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  33.11 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1882  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  35.79 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0565  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  35.79 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  33.43 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0467  malate/L-lactate dehydrogenase  35.79 
 
 		 344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  29.91 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  33.83 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  33.83 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12130  malate dehydrogenase (NAD)  27.88 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  33.46 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4028  malate/L-lactate dehydrogenase  34.32 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0113292  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.27 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4818  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.32 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.949996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  28.57 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.65 
 
 		 353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  31.76 
 
 		 351 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  30.29 
 
 		 351 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  35.32 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  31.07 
 
 		 356 aa  113  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48020  putative L-malate dehydrogenase  33.47 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00543766  normal  0.806598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0890  malate dehydrogenase (NADP(+))  30.56 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.416405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.79 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  31.29 
 
 		 350 aa  110  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  34.89 
 
 		 332 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  36.12 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.99 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.93 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  28.03 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  29.6 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.46 
 
 		 364 aa  107  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  32.16 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3323  malate/L-lactate dehydrogenase  28.28 
 
 		 348 aa  106  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.115763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  34.04 
 
 		 341 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  27.98 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  26.05 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  27.98 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  27.98 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  27.68 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  27.98 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  27.68 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  27.68 
 
 		 349 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  35.18 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4858  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.12 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.169234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  34.02 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  27.98 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  29.81 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.32 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  29.22 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4140  putative L-malate dehydrogenase  27.91 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3821  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.18 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.71 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  29.91 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  29.76 
 
 		 358 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  29.29 
 
 		 375 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.03 
 
 		 732 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2141  malate/L-lactate dehydrogenase  31.45 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437506  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.58 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  29.63 
 
 		 361 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  27.11 
 
 		 376 aa  99.8  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  34.51 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  30.89 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  28.57 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.82 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  29.32 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.32 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30 
 
 		 338 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  28.21 
 
 		 349 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  28.21 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  29.32 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  27.35 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  28.21 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  29.32 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  29.32 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  29.54 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  30.06 
 
 		 343 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  28.48 
 
 		 361 aa  97.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  28.79 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  28.48 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>