201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29499 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_29499  predicted protein  100 
 
 
330 aa  671    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.096211 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54834  dehydrogenase  41.87 
 
 
392 aa  224  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.286619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.79 
 
 
349 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  31.83 
 
 
335 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  31.83 
 
 
335 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  31.83 
 
 
335 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  31.41 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3293  malate/L-lactate dehydrogenase  30.79 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769651  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  30.63 
 
 
347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  30.62 
 
 
336 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  30.12 
 
 
337 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.4 
 
 
364 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  29.74 
 
 
345 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  30 
 
 
347 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  29.38 
 
 
347 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  29.72 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  30.67 
 
 
364 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.19 
 
 
383 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.63 
 
 
345 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  30.37 
 
 
364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  26.87 
 
 
349 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  26.87 
 
 
349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.13 
 
 
355 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  29.66 
 
 
351 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.71 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  26.87 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  26.87 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  28.53 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.81 
 
 
353 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  33.99 
 
 
381 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  34.98 
 
 
343 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  27.04 
 
 
349 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  30.65 
 
 
332 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3323  malate/L-lactate dehydrogenase  26.55 
 
 
348 aa  106  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.115763 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  26.73 
 
 
349 aa  106  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  26.73 
 
 
349 aa  106  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  26.73 
 
 
349 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  26.73 
 
 
349 aa  105  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  30.65 
 
 
341 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  26.73 
 
 
349 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4277  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.82 
 
 
361 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  26.73 
 
 
349 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  26.73 
 
 
349 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  30.87 
 
 
341 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3587  malate/L-lactate dehydrogenase  30.34 
 
 
366 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.787615  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  32.01 
 
 
361 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  29.46 
 
 
356 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  31.21 
 
 
334 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  28.27 
 
 
376 aa  102  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  26.39 
 
 
348 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1710  malate/L-lactate dehydrogenase  31.23 
 
 
361 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  30.12 
 
 
361 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0042  malate/L-lactate dehydrogenase  25.95 
 
 
349 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  33.63 
 
 
343 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.84 
 
 
350 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  33.64 
 
 
341 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  31.84 
 
 
350 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1122  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  27.89 
 
 
328 aa  101  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  27.62 
 
 
351 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  27.44 
 
 
361 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1423  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  30.47 
 
 
344 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2191  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  30.47 
 
 
344 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7734  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0876  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  30.47 
 
 
344 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  25.15 
 
 
358 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.05 
 
 
361 aa  99.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  28.92 
 
 
340 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0565  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  30.47 
 
 
344 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48020  putative L-malate dehydrogenase  30 
 
 
334 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00543766  normal  0.806598 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.22 
 
 
353 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  28.12 
 
 
344 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0576  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.71 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.939938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  28.19 
 
 
336 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  28.3 
 
 
340 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  28.57 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0106  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  27.49 
 
 
346 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0971738  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.53 
 
 
364 aa  97.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0467  malate/L-lactate dehydrogenase  30.11 
 
 
344 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  32.24 
 
 
343 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  29.03 
 
 
344 aa  96.7  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.2 
 
 
359 aa  96.3  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3882  2,3-diketo-L-gulonate reductase  27.76 
 
 
332 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3866  2,3-diketo-L-gulonate reductase  27.76 
 
 
332 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4053  2,3-diketo-L-gulonate reductase  27.76 
 
 
332 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.771616  normal  0.431121 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3991  2,3-diketo-L-gulonate reductase  27.76 
 
 
332 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.3 
 
 
732 aa  95.9  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3968  hypothetical protein  28.53 
 
 
364 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3946  2,3-diketo-L-gulonate reductase  27.76 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  28.22 
 
 
340 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  28.22 
 
 
340 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7014  malate dehydrogenase  29.91 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  30.45 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1882  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  34.84 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4818  Malate/L-lactate dehydrogenase  32 
 
 
334 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.949996  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0782  hypothetical protein  29.29 
 
 
353 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4140  putative L-malate dehydrogenase  30.56 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  26.38 
 
 
361 aa  94.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  26.38 
 
 
361 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  26.38 
 
 
361 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  26.67 
 
 
361 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  26.38 
 
 
361 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>