202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0759 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0759  2,3-diketo-L-gulonate reductase  100 
 
 
332 aa  688    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00167663  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3889  2,3-diketo-L-gulonate reductase  74.4 
 
 
332 aa  537  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3692  2,3-diketo-L-gulonate reductase  73.8 
 
 
332 aa  535  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3898  2,3-diketo-L-gulonate reductase  73.19 
 
 
332 aa  528  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3946  2,3-diketo-L-gulonate reductase  73.19 
 
 
332 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3933  2,3-diketo-L-gulonate reductase  72.89 
 
 
332 aa  527  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03427  2,3-diketo-L-gulonate dehydrogenase, NADH-dependent  72.59 
 
 
332 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0135  Malate/L-lactate dehydrogenase  72.59 
 
 
332 aa  526  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0139  2,3-diketo-L-gulonate reductase  72.59 
 
 
332 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4053  2,3-diketo-L-gulonate reductase  73.19 
 
 
332 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.771616  normal  0.431121 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3991  2,3-diketo-L-gulonate reductase  72.89 
 
 
332 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3882  2,3-diketo-L-gulonate reductase  73.19 
 
 
332 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3866  2,3-diketo-L-gulonate reductase  73.19 
 
 
332 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03378  hypothetical protein  72.59 
 
 
332 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3779  2,3-diketo-L-gulonate reductase  72.59 
 
 
332 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4072  2,3-diketo-L-gulonate reductase  72.89 
 
 
332 aa  527  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3947  2,3-diketo-L-gulonate reductase  73.25 
 
 
329 aa  524  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1597  2,3-diketo-L-gulonate reductase  46.83 
 
 
334 aa  331  8e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3438  2,3-diketo-L-gulonate reductase  43.54 
 
 
327 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0576  Malate/L-lactate dehydrogenase  41.19 
 
 
337 aa  265  7e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.939938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1798  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.49 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  31.37 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1400  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.89 
 
 
362 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  31.31 
 
 
347 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  27.38 
 
 
351 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  30.58 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.46 
 
 
732 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  27.36 
 
 
361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1601  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.22 
 
 
354 aa  125  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  26.98 
 
 
350 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  28.49 
 
 
362 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.33 
 
 
349 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  29.32 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  28.66 
 
 
345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  26.58 
 
 
336 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  26.45 
 
 
376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  28.12 
 
 
344 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  27.3 
 
 
368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  28.94 
 
 
348 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.5 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2132  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.84 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1845  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.84 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.957462  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.88 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1632  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.04 
 
 
353 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000326891  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  27.24 
 
 
362 aa  113  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1300  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.6 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  25.88 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0241  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  27.43 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  27.27 
 
 
367 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  25.89 
 
 
343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0618  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.43 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.06 
 
 
360 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.21 
 
 
378 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.63 
 
 
367 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  25.42 
 
 
333 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.63 
 
 
383 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  26.73 
 
 
334 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1446  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.48 
 
 
377 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0751418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.4 
 
 
329 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.95 
 
 
361 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  26.18 
 
 
338 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.22 
 
 
353 aa  105  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  26.57 
 
 
348 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  28.96 
 
 
335 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3968  hypothetical protein  26.1 
 
 
364 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  27.31 
 
 
349 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  25.68 
 
 
337 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  28.96 
 
 
335 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  28.96 
 
 
335 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7014  malate dehydrogenase  25.37 
 
 
349 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  27.74 
 
 
349 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  27.74 
 
 
349 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12130  malate dehydrogenase (NAD)  24.37 
 
 
369 aa  102  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  28.86 
 
 
332 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  26.71 
 
 
365 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  26.76 
 
 
351 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  23.92 
 
 
358 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.44 
 
 
355 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.72 
 
 
372 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  23.46 
 
 
364 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  24.34 
 
 
359 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  24.7 
 
 
343 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4260  malate/L-lactate dehydrogenase  29.3 
 
 
364 aa  99  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  23.03 
 
 
358 aa  99  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  25.3 
 
 
343 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.59 
 
 
353 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  24.45 
 
 
369 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  29.58 
 
 
341 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  28.05 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  26.33 
 
 
361 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.33 
 
 
361 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  26.33 
 
 
361 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  29.17 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  26.33 
 
 
361 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  26.33 
 
 
361 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  25.44 
 
 
349 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0711  malate/L-lactate dehydrogenase  25.47 
 
 
355 aa  97.1  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.707221  normal  0.854883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0890  malate dehydrogenase (NADP(+))  24.93 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.416405  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  25.44 
 
 
349 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  26.33 
 
 
361 aa  96.3  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>