More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2922 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2922  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 312 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.264653  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2058  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5980  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.307628 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1190  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 291 aa  169  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1268  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5907  transcriptional regulator LysR family  34.27 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6858  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001290  transcriptional regulator LysR family protein  31.49 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.913137  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1048  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3569  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.898807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1086  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404999  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4992  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 303 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3977  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 307 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459808  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2352  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 303 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3780  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116323  decreased coverage  0.000992163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4045  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1824  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.381841  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1783  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5212  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0822  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1113  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379059  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0350  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3295  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.923456  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2086  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5073  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 301 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0586  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2171  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3743  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00613556 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4620  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5010  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0444  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641872  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4493  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4485  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5375  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 302 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0891  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.867323  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002638  putative transcriptional regulator LysR family  29.57 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0120713  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3291  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0483  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0840  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1856  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144419  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1967  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.166127  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0983  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288934  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0994  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2120  LysR family regulatory protein  33.22 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0698  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18558  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1122  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2694  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 326 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2005  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 296 aa  142  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0083  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.32 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363159  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5015  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.92 
 
 		 328 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46519  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2429  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.47 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0671136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2215  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 317 aa  142  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.230967  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1256  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.196796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2548  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1019  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0431  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7696  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4750  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4299  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2443  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.56 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.586469  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2385  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5999  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5634  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6490  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0214  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.08 
 
 		 334 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5290  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0902185 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3988  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4215  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.74 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0752  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3505  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5462  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.278821  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3322  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.05 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000222387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1699  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 311 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00239277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0501  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.4 
 
 		 322 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1951  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177582  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1251  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5069  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00568872  normal  0.0350365 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4094  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.987027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7137  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.05 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7408  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2716  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4272  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2386  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3156  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3643  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1725  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 326 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6153  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 330 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6126  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0906  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2764  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.05 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.872031  normal  0.426445 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3737  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.1 
 
 		 314 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2984  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.05 
 
 		 303 aa  135  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0851103  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5716  transcriptional regulator LysR family  33 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340323  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6862  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 333 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0273347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0079  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2665  transcription regulator protein  30.51 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.824942  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3544  DNA-binding transcriptional activator GcvA  30.13 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00470366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3471  DNA-binding transcriptional activator GcvA  30.39 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000267837  hitchhiker  0.000102426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1282  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.82 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433323  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3787  transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>