More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2352 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2352  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
303 aa  624  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4992  LysR family transcriptional regulator  96.69 
 
 
303 aa  607  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3743  LysR family transcriptional regulator  95.36 
 
 
303 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00613556 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4620  LysR family transcriptional regulator  95.36 
 
 
303 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3780  LysR family transcriptional regulator  94.37 
 
 
303 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116323  decreased coverage  0.000992163 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3030  LysR family transcriptional regulator  74.67 
 
 
305 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0262827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0891  LysR family transcriptional regulator  63.21 
 
 
299 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.867323  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00415  transcription regulator protein  56.62 
 
 
303 aa  362  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2803  transcriptional regulator, LysR family  53.38 
 
 
298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.692324  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2531  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  53.04 
 
 
303 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2716  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
301 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1666  gp58  47.28 
 
 
384 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000292793  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001290  transcriptional regulator LysR family protein  40 
 
 
308 aa  233  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.913137  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5375  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7696  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
341 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0818  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
309 aa  196  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0786272  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1856  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144419  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0840  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
301 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0483  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
299 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1967  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
299 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.166127  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2120  LysR family regulatory protein  36.95 
 
 
339 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0994  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
299 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0698  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
343 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18558  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5074  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 
304 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820352 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2779  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0752  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
292 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3569  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
310 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.898807  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5212  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 
301 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3291  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
308 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0586  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3295  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 
308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.923456  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5073  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6126  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 
299 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6145  transcriptional regulator, LysR family  35.05 
 
 
307 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.493104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3322  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.18 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000222387  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5010  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3471  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.86 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000267837  hitchhiker  0.000102426 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2764  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.53 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.872031  normal  0.426445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3254  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.34 
 
 
304 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655611  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1052  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.71 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4485  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
308 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0999  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.71 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272283  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3221  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.71 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000086091  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1259  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
288 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3207  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.69 
 
 
305 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00274599  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3127  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.69 
 
 
305 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000208594  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3144  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.69 
 
 
305 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3307  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.69 
 
 
305 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1574  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
304 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3192  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.69 
 
 
305 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00535836  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2783  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.23 
 
 
303 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.029199  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02659  DNA-binding transcriptional dual regulator  34.35 
 
 
305 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0880  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 
305 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.630361  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2949  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.35 
 
 
305 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000549414  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3114  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.35 
 
 
305 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000698481  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2984  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.18 
 
 
303 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0851103  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02620  hypothetical protein  34.35 
 
 
305 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4072  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.35 
 
 
305 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000156513  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0904  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.35 
 
 
305 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3062  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.35 
 
 
305 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000830878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2952  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.35 
 
 
305 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.32585e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6858  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
307 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1149  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0418  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.32 
 
 
306 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171121  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2894  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.58 
 
 
303 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00417784  hitchhiker  0.00000518904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0097  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
299 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.603539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2724  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.58 
 
 
303 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000916948  normal  0.0913399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2519  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 
305 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  hitchhiker  0.00756718 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1389  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.24 
 
 
303 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1364  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.24 
 
 
303 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0933505  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3881  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
297 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2996  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.24 
 
 
303 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174451  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1350  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.24 
 
 
303 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.960187  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2795  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.58 
 
 
303 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0431  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
327 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2429  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.23 
 
 
303 aa  159  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0671136  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1282  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.24 
 
 
303 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433323  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01183  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.31 
 
 
306 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1533  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.91 
 
 
303 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1341  transcriptional regulator, LysR family  35.81 
 
 
305 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.281725  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00400  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
304 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.119408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2531  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 
295 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0079  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
299 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353876 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4215  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.33 
 
 
322 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0501  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.67 
 
 
322 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0370633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2565  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.56 
 
 
303 aa  156  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2203  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.59 
 
 
303 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0223993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0030  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.76 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3977  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0094  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.686241  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3805  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.35 
 
 
305 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000401969  unclonable  0.0000000245083 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004252  glycine cleavage system transcriptional activator GcvA  34.01 
 
 
306 aa  155  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000016906  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2922  transcriptional regulator, LysR family  31.48 
 
 
312 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.264653  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2694  LysR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
326 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0214  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.33 
 
 
334 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0247  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 
289 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2994  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.35 
 
 
308 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2443  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.83 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.586469  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6490  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
330 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6153  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
330 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0383  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35 
 
 
320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>