More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0445 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0445  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 292 aa  580  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0489  transcriptional regulator, LysR family  82.53 
 
 		 302 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0035  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.69 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0157  trpBA operon transcriptional activator  35.69 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0906  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.306914  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0814  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2169  LysR family regulatory protein  34.32 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225103  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3431  transcriptional regulator, LysR family  34.75 
 
 		 294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4415  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5893  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4194  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0402435 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6674  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0102  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 305 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0084  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3473  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5831  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6198  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0533844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0099  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0099  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000782403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0102  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248307 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0010  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1948  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244059  normal  0.065003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2271  transcriptional regulator, LysR family  33.85 
 
 		 311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0253  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.35 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208187  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6525  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 301 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0039  transcriptional regulator TrpI  36.52 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2674  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.910839 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5754  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5998  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3007  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.82 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00460  transcriptional regulator TrpI  36.9 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.347028 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2922  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.66 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.554203 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0477  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.58 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0293  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.58 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0281  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.58 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3057  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.66 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6131  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3359  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 296 aa  132  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6419  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5256  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5583  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 321 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5947  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 321 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.287273 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6358  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.66 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0384  transcriptional regulator, LysR family protein  29.66 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1729  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6448  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5325  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.972364  normal  0.036575 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3031  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.27 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2398  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.88 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3012  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.88 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1529  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 301 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4417  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.65 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0073  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6163  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.804904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6456  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.450926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1981  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 312 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0171  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 326 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2452  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000228881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2927  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2522  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00304048  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2519  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  hitchhiker  0.00756718 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2614  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000028926 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0100  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.872592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2479  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102884  hitchhiker  0.0063597 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2847  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0783  transcriptional regulator, LysR family  31.74 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6790  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33 
 
 		 305 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668323  hitchhiker  0.00000431754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02110  trpBA operon transcriptional regulator, LysR family; TrpI  33.33 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625987  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0854  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0734  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2429  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.29 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0671136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7468  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1334  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111205 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1341  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.281725  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0661  transcriptional regulator AmpR, putative  33.92 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.486007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4301  transcriptional regulator, LysR family  32.39 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3270  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.321515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1019  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7137  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.55 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0695  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125106 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4049  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769313  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1652  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.287567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1674  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.126025  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0247  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2203  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.62 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0223993  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3322  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.6 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000222387  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3544  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.08 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00470366  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3811  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3509  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3977  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal  0.0154243 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2509  transcriptional regulator, LysR family protein  26.21 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5693  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 307 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000692  putative transcriptional regulator LysR family protein  29.93 
 
 		 294 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5311  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256019  normal  0.0494064 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1637  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0994273  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04893  transcriptional regulator  31.38 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2706  transcriptional regulator, LysR family  30.36 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.173124  hitchhiker  0.000000993281 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3471  DNA-binding transcriptional activator GcvA  30.9 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000267837  hitchhiker  0.000102426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2145  LysR substrate-binding  33.44 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2214  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>