More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4366 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4366  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  625  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5586  LysR family transcriptional regulator  73.38 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.861314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1391  transcriptional regulator, LysR family  63 
 
 		 314 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00658926  normal  0.188344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1327  transcriptional regulator, LysR family  62.67 
 
 		 314 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.251237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0745  LysR family transcriptional regulator  60.51 
 
 		 320 aa  358  7e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528277 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5486  LysR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 313 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2215  LysR family transcriptional regulator  54.82 
 
 		 313 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1094  LysR family transcriptional regulator  56.09 
 
 		 313 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2176  LysR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 313 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0722015  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5901  LysR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 313 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00437173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2193  LysR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2092  LysR family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1086  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.157723  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6490  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0529  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 347 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.438898  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5999  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5634  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7408  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 330 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5904  LysR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 324 aa  185  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6153  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0994  transcriptional regulator, LysR family  36.58 
 
 		 327 aa  179  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414086  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0664  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 325 aa  179  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3294  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 		 321 aa  176  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228779  normal  0.107887 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4044  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2646  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.028717  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0634  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 336 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0613  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 		 336 aa  168  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0112  LysR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 320 aa  168  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0089776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0447  transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3325  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.642488  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001290  transcriptional regulator LysR family protein  32.66 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.913137  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0647  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3977  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459808  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3569  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.898807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0586  LysR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0994  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5074  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00820352 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0483  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1967  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.166127  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0840  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2120  LysR family regulatory protein  36.21 
 
 		 339 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0698  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18558  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5212  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 301 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3295  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.923456  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5073  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1856  LysR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144419  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1574  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4485  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3743  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00613556 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3780  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116323  decreased coverage  0.000992163 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0752  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4620  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5010  LysR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3291  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3737  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.22 
 
 		 312 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4992  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5789  transcriptional regulator, LysR family  35.87 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.04167 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1680  LysR substrate-binding  32.79 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.915427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1999  transcriptional regulator, LysR family  32.79 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0119555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3957  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 314 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2352  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6145  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.493104 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1006  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0891  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.867323  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7696  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0030  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0164  transcriptional regulator, LysR family  32.34 
 
 		 316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6858  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6692  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363849  normal  0.247449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7137  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.91 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2058  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3030  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 305 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0262827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0348  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.425258 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3108  LysR family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  0.186906 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5907  transcriptional regulator LysR family  33.1 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6126  transcriptional regulator, LysR family  32.33 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2946  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3322  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.8 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000222387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0983  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  33.59 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0491  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.46 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3368  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 307 aa  132  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2531  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3270  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.321515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2717  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.624024  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7121  transcriptional regulator LysR family  32.9 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0306023  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0027  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302128  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0818  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0786272  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00400  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.119408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3881  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3544  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.04 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00470366  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2694  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.484374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2214  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2866  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490862  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5375  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3471  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.05 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000267837  hitchhiker  0.000102426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0079  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353876 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0361  DNA-binding transcriptional regulator DsdC  26.05 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2914  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 313 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3138  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 298 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0927  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.76 
 
 		 307 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00141405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>