232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0811 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0943  tellurium resistance protein TerC  98.26 
 
 
344 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0811  integral membrane protein TerC  100 
 
 
344 aa  684    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.13057  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3874  integral membrane protein TerC  70.93 
 
 
345 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00122311  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3786  tellurite resistance protein  70.93 
 
 
345 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000358727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1353  tellurium resistance protein TerC  69.77 
 
 
346 aa  500  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000658877  normal  0.538332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0665  tellurium resistance protein  70.64 
 
 
345 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0010291  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0271  integral membrane protein TerC  77.88 
 
 
331 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3697  Integral membrane protein TerC  68.7 
 
 
347 aa  484  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3904  integral membrane protein TerC  65.98 
 
 
342 aa  455  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0625  membrane protein  55.06 
 
 
334 aa  355  6.999999999999999e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.039209  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0890  integral membrane protein TerC  52.08 
 
 
338 aa  346  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0691  tellurium resistance protein  48.34 
 
 
331 aa  305  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000269141  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  39.46 
 
 
360 aa  215  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  35.94 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  38.02 
 
 
339 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  34.73 
 
 
328 aa  199  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  36.55 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  36.95 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  36.95 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  36.36 
 
 
339 aa  196  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  34.95 
 
 
321 aa  196  6e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  37.26 
 
 
324 aa  193  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  33.74 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  34.26 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  35.93 
 
 
329 aa  189  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  36.08 
 
 
330 aa  189  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  38.1 
 
 
335 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  35.4 
 
 
314 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  38.94 
 
 
314 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  36.2 
 
 
313 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3366  Integral membrane protein TerC  37.63 
 
 
440 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404586  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  36.19 
 
 
344 aa  186  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1943  Integral membrane protein TerC  37.89 
 
 
332 aa  186  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  35.55 
 
 
354 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  37.46 
 
 
334 aa  185  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  35.29 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  35.09 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  40.29 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  35.1 
 
 
327 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  35.1 
 
 
327 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  35.69 
 
 
306 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  34.65 
 
 
312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  35.96 
 
 
327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  38.08 
 
 
334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  35.96 
 
 
313 aa  182  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  36.94 
 
 
320 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  35.58 
 
 
325 aa  182  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  33.13 
 
 
322 aa  182  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  33.53 
 
 
331 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  35.69 
 
 
307 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  37.46 
 
 
329 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  34.22 
 
 
322 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  35.05 
 
 
352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  34.97 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  34.51 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  34.12 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  37.74 
 
 
325 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  34.12 
 
 
322 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  36.62 
 
 
320 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  34.12 
 
 
322 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  34.12 
 
 
322 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  36.33 
 
 
322 aa  179  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  35.33 
 
 
314 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  34.89 
 
 
354 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  34.66 
 
 
328 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  36.31 
 
 
320 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  34.7 
 
 
327 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  34.66 
 
 
325 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  34.66 
 
 
328 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  36.83 
 
 
320 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  34.66 
 
 
328 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  36.2 
 
 
344 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  34.18 
 
 
354 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  34.39 
 
 
359 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  36.62 
 
 
337 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  35.59 
 
 
325 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0479  hypothetical protein  34.59 
 
 
318 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000001102  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  33.54 
 
 
321 aa  176  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  34.56 
 
 
312 aa  175  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  34.81 
 
 
354 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  32.56 
 
 
311 aa  175  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  33.73 
 
 
320 aa  175  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  34.3 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  34.54 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  34.05 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  36.28 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2297  Integral membrane protein TerC  34.97 
 
 
286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.610971  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  33.85 
 
 
305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1566  integral membrane protein TerC  34.84 
 
 
320 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  35.21 
 
 
327 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  34.25 
 
 
328 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  33.77 
 
 
334 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  34.01 
 
 
338 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  36.39 
 
 
346 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5754  Integral membrane protein TerC  31.23 
 
 
354 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  36.28 
 
 
347 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  37.87 
 
 
373 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  37.64 
 
 
308 aa  169  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  35.14 
 
 
317 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  35.56 
 
 
322 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>