233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0625 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0625  membrane protein  100 
 
 
334 aa  664    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.039209  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0691  tellurium resistance protein  66.97 
 
 
331 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000269141  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0890  integral membrane protein TerC  67.75 
 
 
338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3874  integral membrane protein TerC  52.35 
 
 
345 aa  348  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00122311  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3786  tellurite resistance protein  52.06 
 
 
345 aa  347  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000358727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0665  tellurium resistance protein  52.06 
 
 
345 aa  345  6e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0010291  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1353  tellurium resistance protein TerC  51.47 
 
 
346 aa  343  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000658877  normal  0.538332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0943  tellurium resistance protein TerC  55.65 
 
 
344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0811  integral membrane protein TerC  55.06 
 
 
344 aa  338  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.13057  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3904  integral membrane protein TerC  48.82 
 
 
342 aa  328  7e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3697  Integral membrane protein TerC  51.63 
 
 
347 aa  322  5e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0271  integral membrane protein TerC  55.41 
 
 
331 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  38.89 
 
 
321 aa  210  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  37.65 
 
 
321 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  39.24 
 
 
360 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  40.07 
 
 
328 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  39.44 
 
 
306 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  37.5 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  40.06 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  36.11 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  36.91 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  40.68 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  38.32 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  37.06 
 
 
314 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  37.86 
 
 
320 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  36.23 
 
 
311 aa  192  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  34.91 
 
 
322 aa  192  7e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  35.83 
 
 
312 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  39.93 
 
 
337 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  38.31 
 
 
313 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  38.89 
 
 
330 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  34.37 
 
 
331 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  37.74 
 
 
324 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  36.93 
 
 
310 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  39.13 
 
 
314 aa  186  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  35.49 
 
 
322 aa  186  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  39.05 
 
 
334 aa  185  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  37.97 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  37.04 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  37.99 
 
 
343 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  38.46 
 
 
347 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  38.46 
 
 
346 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  36.23 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  35.31 
 
 
344 aa  182  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  37.41 
 
 
322 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  37.41 
 
 
322 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  37.41 
 
 
322 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  36.08 
 
 
344 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1943  Integral membrane protein TerC  36.14 
 
 
332 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  35.65 
 
 
320 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  38.87 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  36.43 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  36.83 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  37.17 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  37.59 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  36.83 
 
 
327 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  36.83 
 
 
327 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  42.16 
 
 
312 aa  180  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  35.11 
 
 
332 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  34.24 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  41 
 
 
354 aa  179  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  37.79 
 
 
318 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  35.05 
 
 
325 aa  179  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  35.74 
 
 
325 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5754  Integral membrane protein TerC  30.62 
 
 
354 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  35.69 
 
 
325 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  35.95 
 
 
352 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  36.11 
 
 
328 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  36.11 
 
 
328 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  36.84 
 
 
334 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  40.23 
 
 
329 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  37.14 
 
 
327 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  35.44 
 
 
325 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  36.75 
 
 
337 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  36.43 
 
 
320 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0479  hypothetical protein  36.22 
 
 
318 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000001102  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  36.11 
 
 
328 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1647  Integral membrane protein TerC  37 
 
 
279 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.409513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  36.43 
 
 
320 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  36.11 
 
 
328 aa  175  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  36.86 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  41.33 
 
 
373 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  34.1 
 
 
354 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  36.86 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  35.22 
 
 
321 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  34.64 
 
 
354 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  39.27 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2008  integral membrane protein TerC  37.87 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0222851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  33.75 
 
 
399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  37.79 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  34.34 
 
 
354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  34.43 
 
 
354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  37.18 
 
 
308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  34.3 
 
 
338 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  35.78 
 
 
327 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  36.03 
 
 
339 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  35.49 
 
 
328 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  32.8 
 
 
332 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  39.34 
 
 
334 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1566  integral membrane protein TerC  35.64 
 
 
320 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>