More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2280 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03613  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  55.95 
 
 
609 aa  693    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  55.95 
 
 
609 aa  693    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1985  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  52.74 
 
 
611 aa  639    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58 
 
 
611 aa  714    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03557  hypothetical protein  55.95 
 
 
609 aa  693    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4942  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  53.39 
 
 
610 aa  659    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4173  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.11 
 
 
609 aa  699    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.33 
 
 
609 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5595  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.87 
 
 
611 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.41 
 
 
610 aa  690    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2893  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.32 
 
 
604 aa  660    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2748  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.16 
 
 
604 aa  659    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5117  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.7 
 
 
611 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2074  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  77.18 
 
 
614 aa  973    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.666768  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  55.25 
 
 
610 aa  689    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2793  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  53.71 
 
 
609 aa  645    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5165  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.95 
 
 
609 aa  694    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.15 
 
 
609 aa  698    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4142  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.48 
 
 
609 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3071  glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerising  53.46 
 
 
611 aa  640    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.96 
 
 
610 aa  682    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.84 
 
 
611 aa  712    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0013  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing]  52.74 
 
 
611 aa  641    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3998  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.29 
 
 
611 aa  669    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.52 
 
 
613 aa  653    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.851914  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58 
 
 
611 aa  715    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4564  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.06 
 
 
610 aa  695    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.95 
 
 
609 aa  693    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.9 
 
 
610 aa  724    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.14 
 
 
609 aa  667    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1692  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  55.97 
 
 
617 aa  681    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0313  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  51.28 
 
 
615 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4136  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.66 
 
 
609 aa  690    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0361576  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4244  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.95 
 
 
609 aa  693    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.517855  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4097  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.95 
 
 
609 aa  694    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4250  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.48 
 
 
609 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4198  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.02 
 
 
611 aa  688    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.16 
 
 
611 aa  711    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6350  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.03 
 
 
611 aa  685    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  55.81 
 
 
611 aa  682    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.15 
 
 
610 aa  705    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4086  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.95 
 
 
609 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51890  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.06 
 
 
611 aa  666    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.4 
 
 
609 aa  670    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2280  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  100 
 
 
615 aa  1262    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0733562 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3280  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  57.58 
 
 
610 aa  672    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2397  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  77.83 
 
 
614 aa  974    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4199  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.11 
 
 
609 aa  700    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118902  normal  0.122608 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.47 
 
 
610 aa  702    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.24 
 
 
609 aa  665    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.38 
 
 
616 aa  702    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4229  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.11 
 
 
609 aa  700    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.95 
 
 
609 aa  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3881  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  55.25 
 
 
610 aa  690    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.46 
 
 
608 aa  674    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.07 
 
 
609 aa  665    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251004 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.48 
 
 
609 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.72 
 
 
610 aa  655    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3920  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.5 
 
 
609 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121785  normal  0.0336662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4012  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.5 
 
 
609 aa  661    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0405163  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2865  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  53.47 
 
 
610 aa  639    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4040  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.24 
 
 
609 aa  672    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3302  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  56.06 
 
 
608 aa  648    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4261  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.22 
 
 
610 aa  698    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4265  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.95 
 
 
609 aa  693    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.47 
 
 
609 aa  671    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664271  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.03 
 
 
611 aa  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.542365  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3951  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.15 
 
 
609 aa  664    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101747  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4070  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.95 
 
 
609 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4361  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.15 
 
 
609 aa  667    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284496  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03884  Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase  54.93 
 
 
610 aa  687    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.5 
 
 
609 aa  661    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.83 
 
 
609 aa  669    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4305  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.14 
 
 
609 aa  668    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.312496  hitchhiker  0.000000000243426 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.14 
 
 
609 aa  667    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.75 
 
 
609 aa  671    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.06 
 
 
611 aa  705    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0062  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.37 
 
 
612 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0070  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.21 
 
 
612 aa  631  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2890  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  51.29 
 
 
605 aa  620  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000354922 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0178  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.4 
 
 
612 aa  617  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.149941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3931  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  51.7 
 
 
607 aa  617  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0230  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  51.36 
 
 
612 aa  616  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  51.77 
 
 
610 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.698391  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1991  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  51.05 
 
 
610 aa  618  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0336  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  51.77 
 
 
610 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3605  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  52.35 
 
 
608 aa  618  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1706  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  51.21 
 
 
610 aa  617  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3379  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  51.61 
 
 
610 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2426  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  52.58 
 
 
609 aa  615  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.184466  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2242  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  51.61 
 
 
610 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252302  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3050  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  51.61 
 
 
610 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0208  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  50.81 
 
 
605 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3002  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  51.13 
 
 
605 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978616  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0187  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.01 
 
 
612 aa  614  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.225052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2368  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  50.96 
 
 
605 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  51.61 
 
 
610 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3728  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  51.13 
 
 
605 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71832  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2982  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  50.96 
 
 
605 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2042  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  51.61 
 
 
610 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>