More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1238 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03613  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  56.77 
 
 
609 aa  676    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.77 
 
 
609 aa  676    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4265  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.77 
 
 
609 aa  676    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.59 
 
 
611 aa  689    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0015  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.26 
 
 
610 aa  655    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4942  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  53.83 
 
 
610 aa  651    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6350  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.28 
 
 
611 aa  663    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.44 
 
 
609 aa  661    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5595  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.21 
 
 
611 aa  664    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.42 
 
 
611 aa  689    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5117  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.42 
 
 
611 aa  666    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2074  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.66 
 
 
614 aa  643    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.666768  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4250  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.77 
 
 
609 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4261  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.77 
 
 
610 aa  672    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.46 
 
 
609 aa  663    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2793  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  55.46 
 
 
609 aa  646    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.61 
 
 
609 aa  662    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.44 
 
 
608 aa  677    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3071  glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerising  57.49 
 
 
611 aa  644    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.89 
 
 
610 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.77 
 
 
609 aa  677    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3998  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.4 
 
 
611 aa  653    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4142  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.77 
 
 
609 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.98 
 
 
610 aa  666    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4086  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.61 
 
 
609 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.12 
 
 
609 aa  659    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322632 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0013  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing]  54.27 
 
 
611 aa  638    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1692  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.35 
 
 
617 aa  742    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.75 
 
 
616 aa  684    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54 
 
 
610 aa  661    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4564  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.61 
 
 
610 aa  667    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.32 
 
 
611 aa  667    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.77 
 
 
609 aa  676    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  100 
 
 
613 aa  1239    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.851914  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2280  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.52 
 
 
615 aa  653    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0733562 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.12 
 
 
609 aa  667    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664271  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  57 
 
 
611 aa  688    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.08 
 
 
611 aa  693    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4070  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.77 
 
 
609 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.79 
 
 
609 aa  660    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3302  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  57.26 
 
 
608 aa  652    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.61 
 
 
609 aa  669    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3280  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  59.74 
 
 
610 aa  675    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4198  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.77 
 
 
611 aa  662    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2397  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.18 
 
 
614 aa  636    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03884  Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase  54.49 
 
 
610 aa  660    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4229  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.63 
 
 
609 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3951  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.44 
 
 
609 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4136  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.66 
 
 
609 aa  671    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0361576  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4244  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.77 
 
 
609 aa  676    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.517855  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.32 
 
 
610 aa  654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3881  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.98 
 
 
610 aa  671    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1985  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  54.27 
 
 
611 aa  637    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4361  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.44 
 
 
609 aa  662    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284496  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51890  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.75 
 
 
611 aa  641    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.56 
 
 
610 aa  715    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.63 
 
 
610 aa  654    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3920  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.61 
 
 
609 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121785  normal  0.0336662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4012  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.61 
 
 
609 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0405163  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2865  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  59.22 
 
 
610 aa  686    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4040  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.77 
 
 
609 aa  665    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.61 
 
 
609 aa  662    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.77 
 
 
609 aa  663    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251004 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4199  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.63 
 
 
609 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118902  normal  0.122608 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4097  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.77 
 
 
609 aa  676    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.96 
 
 
611 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.542365  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  55.46 
 
 
610 aa  672    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5165  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.61 
 
 
609 aa  673    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212663 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.77 
 
 
609 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4305  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.44 
 
 
609 aa  660    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.312496  hitchhiker  0.000000000243426 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03557  hypothetical protein  56.77 
 
 
609 aa  676    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.61 
 
 
609 aa  663    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.42 
 
 
611 aa  677    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2426  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.91 
 
 
609 aa  654    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.184466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.61 
 
 
609 aa  665    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4173  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.63 
 
 
609 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2893  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.09 
 
 
604 aa  632  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2748  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.09 
 
 
604 aa  632  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2584  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.38 
 
 
616 aa  628  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.946253  normal  0.069617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0313  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  53.31 
 
 
615 aa  626  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.69 
 
 
611 aa  615  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3931  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  52.37 
 
 
607 aa  613  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3728  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.34 
 
 
605 aa  610  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71832  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0208  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.85 
 
 
605 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6331  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.85 
 
 
605 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3605  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  52.69 
 
 
608 aa  598  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3379  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53 
 
 
610 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53 
 
 
610 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.698391  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0336  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53 
 
 
610 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3050  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53 
 
 
610 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2242  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53 
 
 
610 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252302  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2368  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.53 
 
 
605 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3002  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.69 
 
 
605 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978616  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3029  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.53 
 
 
605 aa  598  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2982  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.53 
 
 
605 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53 
 
 
610 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2042  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53 
 
 
610 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3029  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  51.61 
 
 
607 aa  592  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0118  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  50.9 
 
 
609 aa  593  1e-168  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.101384  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.37 
 
 
605 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>