More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3002 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03613  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  55.16 
 
 
609 aa  651    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  55.16 
 
 
609 aa  651    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4136  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.97 
 
 
609 aa  660    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0361576  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.27 
 
 
611 aa  696    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0015  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.21 
 
 
610 aa  653    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0178  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  74.51 
 
 
612 aa  919    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.149941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4942  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  52.37 
 
 
610 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.94 
 
 
611 aa  693    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.85 
 
 
609 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5595  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.28 
 
 
611 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3059  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.19 
 
 
638 aa  747    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.229326  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3379  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  89.84 
 
 
610 aa  1125    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4229  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.23 
 
 
609 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.1 
 
 
611 aa  694    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5117  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.12 
 
 
611 aa  659    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2977  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  95.7 
 
 
605 aa  1190    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392279  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3931  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  61.48 
 
 
607 aa  749    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0636  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.19 
 
 
638 aa  747    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0230  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  75.33 
 
 
612 aa  940    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2793  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  62.36 
 
 
609 aa  726    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4244  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.16 
 
 
609 aa  651    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.517855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  89.84 
 
 
610 aa  1124    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.698391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1560  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.66 
 
 
633 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1120  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  71.74 
 
 
605 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3071  glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerising  56.05 
 
 
611 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.75 
 
 
610 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0336  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  89.67 
 
 
610 aa  1122    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.26 
 
 
608 aa  652    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  63.88 
 
 
609 aa  794    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000225496  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4463  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  71.4 
 
 
605 aa  884    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14983  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6331  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  97.52 
 
 
605 aa  1206    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1944  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  60.46 
 
 
607 aa  735    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.392427  normal  0.591657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2724  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  65.19 
 
 
609 aa  810    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2042  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  89.84 
 
 
610 aa  1125    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3951  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.85 
 
 
609 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101747  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2740  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  71.5 
 
 
607 aa  857    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  89.84 
 
 
610 aa  1125    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1692  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  52.67 
 
 
617 aa  637    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0313  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.04 
 
 
615 aa  727    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.68 
 
 
609 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3002  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  100 
 
 
605 aa  1234    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978616  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0348  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  71.24 
 
 
605 aa  880    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.578101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0288  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  89.51 
 
 
610 aa  1103    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.16 
 
 
609 aa  651    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4036  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.79 
 
 
629 aa  874    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.529211 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2242  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  89.84 
 
 
610 aa  1125    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252302  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5899  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  66.2 
 
 
639 aa  832    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.85 
 
 
609 aa  641    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1074  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.38 
 
 
627 aa  871    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0149883  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  55.79 
 
 
611 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4173  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.23 
 
 
609 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  61.05 
 
 
611 aa  748    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0675  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.99 
 
 
616 aa  891    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0208  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  86.94 
 
 
605 aa  1083    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.68 
 
 
609 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0560  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  72.21 
 
 
619 aa  905    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.927649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6350  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.59 
 
 
611 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3280  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  56.37 
 
 
610 aa  639    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4199  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.23 
 
 
609 aa  652    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118902  normal  0.122608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2503  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  95.54 
 
 
605 aa  1189    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208753  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0187  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  75.65 
 
 
612 aa  939    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.225052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4097  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.16 
 
 
609 aa  652    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.72 
 
 
609 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.19 
 
 
638 aa  747    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.63 
 
 
616 aa  682    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4265  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.16 
 
 
609 aa  651    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0846  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  71.4 
 
 
605 aa  885    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2368  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  99.67 
 
 
605 aa  1231    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4266  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.79 
 
 
607 aa  742    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1309  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  71.57 
 
 
605 aa  887    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.61 
 
 
609 aa  638    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664271  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  71.57 
 
 
605 aa  879    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.19 
 
 
638 aa  747    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1458  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.56 
 
 
643 aa  744    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.94 
 
 
611 aa  686    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3920  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.52 
 
 
609 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121785  normal  0.0336662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4012  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.52 
 
 
609 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0405163  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0118  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.67 
 
 
609 aa  724    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.101384  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1232  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.59 
 
 
631 aa  730    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409865  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3029  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  97.36 
 
 
605 aa  1207    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40621  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3511  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.78 
 
 
607 aa  729    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.298041  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5227  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  64.86 
 
 
609 aa  788    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  72.4 
 
 
605 aa  887    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.27 
 
 
611 aa  668    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.542365  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0641  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.13 
 
 
636 aa  875    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325267  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1327  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  71.4 
 
 
605 aa  885    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2982  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  99.67 
 
 
605 aa  1231    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3445  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  64.86 
 
 
609 aa  806    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4100  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.79 
 
 
607 aa  742    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.27 
 
 
618 aa  875    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.442506 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3050  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  89.84 
 
 
610 aa  1125    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.68 
 
 
609 aa  639    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.68 
 
 
609 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4361  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.01 
 
 
609 aa  643    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284496  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4486  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.45 
 
 
607 aa  734    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.503436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2759  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  63.74 
 
 
673 aa  814    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202066  normal  0.017442 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1991  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  67.7 
 
 
610 aa  839    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.68 
 
 
609 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.68 
 
 
611 aa  657    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.58 
 
 
610 aa  657    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>