More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5481 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_3002  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.4 
 
 
605 aa  887    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978616  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0103  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.51 
 
 
609 aa  700    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4199  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.25 
 
 
609 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118902  normal  0.122608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.44 
 
 
611 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0015  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.27 
 
 
610 aa  660    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0178  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  67.65 
 
 
612 aa  822    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.149941 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3627  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  99.5 
 
 
605 aa  1223    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6350  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.68 
 
 
611 aa  651    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1501  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.4 
 
 
605 aa  863    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5595  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.37 
 
 
611 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3059  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.05 
 
 
638 aa  688    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.229326  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3379  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.79 
 
 
610 aa  884    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.26 
 
 
609 aa  728    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000225496  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4229  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.25 
 
 
609 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5117  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.12 
 
 
611 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2503  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  73.39 
 
 
605 aa  894    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208753  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3931  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  59.18 
 
 
607 aa  718    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3499  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.38 
 
 
612 aa  703    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0230  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  67.97 
 
 
612 aa  846    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0641  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.48 
 
 
636 aa  786    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325267  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2793  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  59.41 
 
 
609 aa  702    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.49 
 
 
616 aa  678    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.76 
 
 
610 aa  643    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.62 
 
 
610 aa  882    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.698391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1560  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.5 
 
 
633 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1120  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  88.6 
 
 
605 aa  1101    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3071  glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerising  56.35 
 
 
611 aa  644    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.26 
 
 
610 aa  649    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.05 
 
 
638 aa  688    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.17 
 
 
609 aa  636    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5899  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.15 
 
 
639 aa  766    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4463  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  94.21 
 
 
605 aa  1169    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14983  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6331  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.56 
 
 
605 aa  894    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1944  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  60.13 
 
 
607 aa  730    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.392427  normal  0.591657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2724  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  60.76 
 
 
609 aa  738    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3394  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.92 
 
 
609 aa  719    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549764  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4173  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.25 
 
 
609 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4486  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.97 
 
 
607 aa  712    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.503436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4036  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.59 
 
 
629 aa  784    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.529211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3605  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.52 
 
 
608 aa  691    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0313  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.42 
 
 
615 aa  709    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  53.19 
 
 
608 aa  638    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2242  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.79 
 
 
610 aa  884    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252302  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0348  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  89.26 
 
 
605 aa  1116    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.578101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0288  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.46 
 
 
610 aa  880    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1706  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.16 
 
 
610 aa  734    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.79 
 
 
610 aa  884    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0507  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.38 
 
 
612 aa  707    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00435471 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  88.43 
 
 
605 aa  1097    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1074  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  64.01 
 
 
627 aa  800    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0149883  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  53.59 
 
 
611 aa  643    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.12 
 
 
611 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.25 
 
 
611 aa  714    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0675  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.7 
 
 
616 aa  794    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0208  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  73.88 
 
 
605 aa  901    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03126  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.51 
 
 
609 aa  698    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0636  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.05 
 
 
638 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0118  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.18 
 
 
609 aa  697    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.101384  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3280  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  56.44 
 
 
610 aa  655    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.05 
 
 
638 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2977  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  73.55 
 
 
605 aa  894    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392279  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0187  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  68.3 
 
 
612 aa  845    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.225052 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1309  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  94.71 
 
 
605 aa  1176    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0560  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  65.59 
 
 
619 aa  812    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.927649 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1991  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.3 
 
 
610 aa  737    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.89 
 
 
605 aa  894    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0846  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  94.71 
 
 
605 aa  1175    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2368  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.07 
 
 
605 aa  884    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4266  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.96 
 
 
607 aa  741    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1232  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.42 
 
 
631 aa  672    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409865  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.93 
 
 
611 aa  683    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3728  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  73.39 
 
 
605 aa  902    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71832  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0336  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.46 
 
 
610 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0095  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  66.29 
 
 
620 aa  821    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607775 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4716  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  67.44 
 
 
605 aa  832    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3423  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.96 
 
 
607 aa  741    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.37 
 
 
611 aa  639    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4076  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.76 
 
 
609 aa  736    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.574993  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0062  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  67.16 
 
 
612 aa  830    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2865  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  57.42 
 
 
610 aa  637    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2804  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.03 
 
 
611 aa  666    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1458  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.61 
 
 
643 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3029  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.56 
 
 
605 aa  892    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40621  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3511  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.3 
 
 
607 aa  707    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.298041  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5227  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.92 
 
 
609 aa  720    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  100 
 
 
605 aa  1228    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.77 
 
 
611 aa  655    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.542365  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1327  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  94.71 
 
 
605 aa  1175    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2982  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.07 
 
 
605 aa  884    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3445  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.92 
 
 
609 aa  739    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4100  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.96 
 
 
607 aa  741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.49 
 
 
618 aa  790    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.442506 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2042  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.79 
 
 
610 aa  884    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2890  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  73.88 
 
 
605 aa  913    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000354922 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3200  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.03 
 
 
611 aa  666    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2740  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  88.3 
 
 
607 aa  1078    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2759  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.58 
 
 
673 aa  749    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202066  normal  0.017442 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3050  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.79 
 
 
610 aa  884    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.44 
 
 
611 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3994  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.63 
 
 
607 aa  712    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13069  normal  0.149287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>