More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4892 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03613  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  69.02 
 
 		 609 aa  863    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  69.02 
 
 		 609 aa  863    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0336  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.73 
 
 		 610 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.34 
 
 		 611 aa  796    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0015  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.64 
 
 		 610 aa  751    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4942  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  76.56 
 
 		 610 aa  982    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0062  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.66 
 
 		 612 aa  652    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  92.45 
 
 		 609 aa  1165    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5595  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  63.5 
 
 		 611 aa  776    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.66 
 
 		 609 aa  876    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3379  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.73 
 
 		 610 aa  638    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2893  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.39 
 
 		 604 aa  692    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2748  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.23 
 
 		 604 aa  691    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5117  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.83 
 
 		 611 aa  784    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2074  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.19 
 
 		 614 aa  658    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.666768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3931  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  56.89 
 
 		 607 aa  687    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03126  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.9 
 
 		 609 aa  667    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0230  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.15 
 
 		 612 aa  656    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.56 
 
 		 611 aa  892    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2793  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  57.45 
 
 		 609 aa  687    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4173  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.66 
 
 		 609 aa  878    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  60.98 
 
 		 610 aa  785    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.57 
 
 		 610 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.698391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4244  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.02 
 
 		 609 aa  863    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.517855  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1120  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  53.44 
 
 		 605 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3071  glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerising  62.75 
 
 		 611 aa  760    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  64.81 
 
 		 610 aa  789    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.73 
 
 		 610 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3002  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.61 
 
 		 605 aa  638    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4265  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.02 
 
 		 609 aa  863    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4463  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  52.62 
 
 		 605 aa  638    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14983  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6331  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.1 
 
 		 605 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4229  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.66 
 
 		 609 aa  878    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0118  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.59 
 
 		 609 aa  678    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.101384  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2280  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.47 
 
 		 615 aa  671    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0733562 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0507  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.93 
 
 		 612 aa  684    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00435471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6350  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  61.7 
 
 		 611 aa  769    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2426  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.03 
 
 		 609 aa  708    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.184466  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1692  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.89 
 
 		 617 aa  713    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0313  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.22 
 
 		 615 aa  671    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  95.07 
 
 		 609 aa  1196    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322632 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3050  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.73 
 
 		 610 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0348  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  52.95 
 
 		 605 aa  643    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.578101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0288  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.38 
 
 		 610 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.02 
 
 		 609 aa  863    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.37 
 
 		 618 aa  638    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.442506 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0013  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing]  55.65 
 
 		 611 aa  703    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3728  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.16 
 
 		 605 aa  663    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.7 
 
 		 610 aa  887    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1501  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.66 
 
 		 605 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  74.8 
 
 		 611 aa  950    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.11 
 
 		 608 aa  754    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.92 
 
 		 611 aa  654    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0675  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.02 
 
 		 616 aa  650    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0208  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.92 
 
 		 605 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  91.95 
 
 		 609 aa  1165    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.02 
 
 		 609 aa  861    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1985  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  55.65 
 
 		 611 aa  704    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3280  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  59.57 
 
 		 610 aa  712    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  92.61 
 
 		 609 aa  1171    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2397  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.36 
 
 		 614 aa  659    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0187  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.01 
 
 		 612 aa  651    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.225052 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0138  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  53.67 
 
 		 612 aa  660    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.266568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4199  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.66 
 
 		 609 aa  878    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118902  normal  0.122608 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  62.34 
 
 		 616 aa  793    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2242  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.73 
 
 		 610 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252302  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  93.76 
 
 		 609 aa  1183    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0846  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  51.97 
 
 		 605 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2368  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.28 
 
 		 605 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4097  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.02 
 
 		 609 aa  863    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2941 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3881  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  70.33 
 
 		 610 aa  897    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  92.61 
 
 		 609 aa  1171    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  94.58 
 
 		 609 aa  1186    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000251004 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.9 
 
 		 610 aa  909    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0560  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  53.37 
 
 		 619 aa  638    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.927649 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  66.28 
 
 		 610 aa  809    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3920  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  92.78 
 
 		 609 aa  1170    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121785  normal  0.0336662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4012  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  92.61 
 
 		 609 aa  1168    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0405163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2865  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  59.67 
 
 		 610 aa  748    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4040  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  92.61 
 
 		 609 aa  1167    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.01 
 
 		 611 aa  791    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3029  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.44 
 
 		 605 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40621  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0103  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.43 
 
 		 609 aa  677    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.18 
 
 		 611 aa  796    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2890  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.43 
 
 		 605 aa  662    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000354922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  61.7 
 
 		 611 aa  770    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1327  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  51.97 
 
 		 605 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2982  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.28 
 
 		 605 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0095  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.4 
 
 		 620 aa  638    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  62.52 
 
 		 611 aa  779    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4036  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.08 
 
 		 629 aa  637    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529211 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4361  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  92.78 
 
 		 609 aa  1174    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1309  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  51.97 
 
 		 605 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  92.78 
 
 		 609 aa  1166    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3951  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  93.1 
 
 		 609 aa  1176    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4136  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.18 
 
 		 609 aa  867    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  53.61 
 
 		 605 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 609 aa  1251    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2042  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.73 
 
 		 610 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  90.31 
 
 		 609 aa  1141    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>