More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0560 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3423  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.39 
 
 
607 aa  736    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.37 
 
 
609 aa  638    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664271  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3627  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  65.43 
 
 
605 aa  810    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.24 
 
 
611 aa  688    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0015  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  55.84 
 
 
610 aa  635    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0178  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.93 
 
 
612 aa  882    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.149941 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0103  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.81 
 
 
609 aa  714    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  66.1 
 
 
638 aa  841    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4716  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  62.04 
 
 
605 aa  778    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5595  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.8 
 
 
611 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3059  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  66.1 
 
 
638 aa  841    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.229326  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3379  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.79 
 
 
610 aa  894    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4076  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  70.11 
 
 
609 aa  897    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.574993  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.21 
 
 
611 aa  687    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5117  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.28 
 
 
611 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2503  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.57 
 
 
605 aa  897    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208753  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3931  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  62.02 
 
 
607 aa  765    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1232  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  65.88 
 
 
631 aa  824    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409865  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0230  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.86 
 
 
612 aa  918    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  83.17 
 
 
618 aa  1062    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.442506 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2793  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  63.69 
 
 
609 aa  756    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  69.14 
 
 
609 aa  895    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000225496  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.79 
 
 
610 aa  895    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.698391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1560  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  66.3 
 
 
633 aa  841    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1120  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  66.4 
 
 
605 aa  814    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3071  glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerising  55.27 
 
 
611 aa  639    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.76 
 
 
610 aa  653    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  66.24 
 
 
605 aa  813    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.88 
 
 
609 aa  639    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1309  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  64.78 
 
 
605 aa  810    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4463  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  64.94 
 
 
605 aa  809    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14983  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6331  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.73 
 
 
605 aa  900    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1944  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  59.74 
 
 
607 aa  733    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.392427  normal  0.591657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2724  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  70.11 
 
 
609 aa  898    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0095  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  85.19 
 
 
620 aa  1084    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6350  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.58 
 
 
611 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1458  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  65.43 
 
 
643 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3050  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.79 
 
 
610 aa  894    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0118  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.81 
 
 
609 aa  712    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.101384  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0313  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  62.02 
 
 
615 aa  751    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.21 
 
 
605 aa  902    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1991  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  62.84 
 
 
610 aa  786    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0348  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  65.75 
 
 
605 aa  814    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.578101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0288  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.96 
 
 
610 aa  885    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.88 
 
 
609 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0641  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  80.72 
 
 
636 aa  1043    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325267  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  66.1 
 
 
638 aa  841    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5899  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  78.66 
 
 
639 aa  1005    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1706  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  63.32 
 
 
610 aa  790    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1074  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  80.67 
 
 
627 aa  1028    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0149883  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  54.63 
 
 
611 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.76 
 
 
611 aa  690    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  60.8 
 
 
611 aa  751    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0675  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  83.28 
 
 
616 aa  1067    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0208  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.37 
 
 
605 aa  905    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.79 
 
 
610 aa  894    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4486  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.39 
 
 
607 aa  720    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.503436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3280  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  56.64 
 
 
610 aa  654    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.92 
 
 
611 aa  684    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2977  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.57 
 
 
605 aa  898    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392279  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0187  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.36 
 
 
612 aa  912    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.225052 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.35 
 
 
609 aa  638    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322632 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  52.87 
 
 
608 aa  635    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2042  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.79 
 
 
610 aa  894    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3002  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.21 
 
 
605 aa  905    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978616  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.99 
 
 
609 aa  641    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0846  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  64.62 
 
 
605 aa  808    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2368  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.89 
 
 
605 aa  902    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4266  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.39 
 
 
607 aa  737    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.08 
 
 
610 aa  650    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1501  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.41 
 
 
605 aa  891    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4361  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.72 
 
 
609 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284496  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0336  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.79 
 
 
610 aa  895    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.01 
 
 
616 aa  668    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.6 
 
 
610 aa  635    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3394  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  70.11 
 
 
609 aa  882    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549764  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3728  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.89 
 
 
605 aa  899    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71832  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0062  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.13 
 
 
612 aa  890    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03126  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  60 
 
 
609 aa  721    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4040  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.17 
 
 
609 aa  644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2740  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  66.18 
 
 
607 aa  792    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3029  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.89 
 
 
605 aa  900    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40621  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3511  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.03 
 
 
607 aa  724    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.298041  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5227  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  70.44 
 
 
609 aa  884    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  65.59 
 
 
605 aa  812    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.42 
 
 
611 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.542365  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1327  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  64.62 
 
 
605 aa  808    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2982  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.89 
 
 
605 aa  902    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3445  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  70.11 
 
 
609 aa  897    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4100  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.39 
 
 
607 aa  737    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4036  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  79.56 
 
 
629 aa  1013    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.529211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2759  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  72.26 
 
 
673 aa  944    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202066  normal  0.017442 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.44 
 
 
610 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.21 
 
 
609 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0636  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  66.1 
 
 
638 aa  841    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0560  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  100 
 
 
619 aa  1259    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.927649 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2242  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.79 
 
 
610 aa  894    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252302  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2890  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.6 
 
 
605 aa  890    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000354922 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3994  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.55 
 
 
607 aa  720    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13069  normal  0.149287 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.28 
 
 
611 aa  652    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>