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for query gene Bcen2424_3445 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0095  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  66.94 
 
 
620 aa  861    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3394  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  97.7 
 
 
609 aa  1195    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549764  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.11 
 
 
611 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0620  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  66.35 
 
 
636 aa  853    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0178  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.15 
 
 
612 aa  777    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.149941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1001  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  66.03 
 
 
626 aa  843    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.78 
 
 
611 aa  656    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4076  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  99.34 
 
 
609 aa  1235    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.574993  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3059  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  81.5 
 
 
638 aa  1032    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.229326  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3379  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  65.8 
 
 
610 aa  809    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0070  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.15 
 
 
612 aa  796    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3605  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.14 
 
 
608 aa  684    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2977  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  64.86 
 
 
605 aa  805    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392279  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3931  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  59.77 
 
 
607 aa  721    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3728  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  64.86 
 
 
605 aa  810    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71832  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0230  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  64.12 
 
 
612 aa  800    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2793  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  61.79 
 
 
609 aa  729    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  65.8 
 
 
610 aa  810    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.698391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1560  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  82.15 
 
 
633 aa  1035    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1120  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.58 
 
 
605 aa  746    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3423  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.43 
 
 
607 aa  700    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5899  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  64.63 
 
 
639 aa  837    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3002  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  64.86 
 
 
605 aa  806    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978616  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4463  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  60.92 
 
 
605 aa  744    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14983  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6331  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  64.86 
 
 
605 aa  805    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1944  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  57.61 
 
 
607 aa  696    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.392427  normal  0.591657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2724  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  98.52 
 
 
609 aa  1229    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0560  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  70.11 
 
 
619 aa  897    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.927649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.02 
 
 
616 aa  641    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.41 
 
 
605 aa  744    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4036  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  65.66 
 
 
629 aa  837    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.529211 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1706  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.8 
 
 
610 aa  731    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0313  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.25 
 
 
615 aa  706    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3499  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.15 
 
 
612 aa  661    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1458  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  80.72 
 
 
643 aa  1030    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0348  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.08 
 
 
605 aa  743    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.578101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0288  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  65.47 
 
 
610 aa  802    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2242  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  65.8 
 
 
610 aa  809    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252302  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2759  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.2 
 
 
673 aa  777    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202066  normal  0.017442 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  81.5 
 
 
638 aa  1032    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0103  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.96 
 
 
609 aa  649    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2740  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.37 
 
 
607 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1074  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  66.88 
 
 
627 aa  847    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0149883  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.7 
 
 
611 aa  706    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0675  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  67.75 
 
 
616 aa  874    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0208  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  65.52 
 
 
605 aa  818    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1309  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.59 
 
 
605 aa  743    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3050  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  65.8 
 
 
610 aa  809    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.11 
 
 
611 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0507  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.99 
 
 
612 aa  662    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00435471 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2503  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  64.7 
 
 
605 aa  805    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208753  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0187  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  64.94 
 
 
612 aa  808    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.225052 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2804  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.42 
 
 
611 aa  649    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0062  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.15 
 
 
612 aa  794    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.62 
 
 
611 aa  659    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3627  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.59 
 
 
605 aa  737    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0846  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.43 
 
 
605 aa  742    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2368  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  64.86 
 
 
605 aa  807    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4266  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.43 
 
 
607 aa  700    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2890  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.38 
 
 
605 aa  798    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000354922 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  94.91 
 
 
609 aa  1191    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000225496  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0636  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  81.5 
 
 
638 aa  1032    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0336  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  65.8 
 
 
610 aa  810    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  81.5 
 
 
638 aa  1032    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0118  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.12 
 
 
609 aa  650    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.101384  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03126  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.7 
 
 
609 aa  659    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4716  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.11 
 
 
605 aa  729    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1991  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.77 
 
 
610 aa  732    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3029  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  65.02 
 
 
605 aa  805    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40621  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3511  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.1 
 
 
607 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.298041  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5227  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  97.37 
 
 
609 aa  1193    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.92 
 
 
605 aa  739    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1327  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.43 
 
 
605 aa  742    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2982  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  64.86 
 
 
605 aa  807    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3445  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  100 
 
 
609 aa  1244    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4100  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.43 
 
 
607 aa  700    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.98 
 
 
610 aa  646    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0641  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  66.35 
 
 
636 aa  854    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325267  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4486  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.94 
 
 
607 aa  674    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.503436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1501  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  64.04 
 
 
605 aa  794    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  65.8 
 
 
610 aa  809    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2042  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  65.8 
 
 
610 aa  809    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  64.86 
 
 
605 aa  805    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3200  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.42 
 
 
611 aa  649    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  67.37 
 
 
618 aa  865    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.442506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3994  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.27 
 
 
607 aa  677    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13069  normal  0.149287 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1232  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  81.14 
 
 
631 aa  1016    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.27 
 
 
611 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.542365  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.36 
 
 
611 aa  629  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6350  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.94 
 
 
611 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.74 
 
 
610 aa  627  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.52 
 
 
610 aa  626  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  52.03 
 
 
610 aa  622  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.12 
 
 
610 aa  623  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.2 
 
 
610 aa  624  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.03 
 
 
610 aa  619  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  52.11 
 
 
611 aa  620  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03884  Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase  51.87 
 
 
610 aa  619  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_3071  glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerising  53.08 
 
 
611 aa  615  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_5117  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.31 
 
 
611 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
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