More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3839 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03613  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  69.51 
 
 		 609 aa  865    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  69.51 
 
 		 609 aa  865    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.54 
 
 		 610 aa  884    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.34 
 
 		 611 aa  790    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0015  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.8 
 
 		 610 aa  740    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4305  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  92.61 
 
 		 609 aa  1168    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.312496  hitchhiker  0.000000000243426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4942  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  77.05 
 
 		 610 aa  982    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  93.43 
 
 		 609 aa  1174    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  92.61 
 
 		 609 aa  1160    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5595  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  63.67 
 
 		 611 aa  766    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3728  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.16 
 
 		 605 aa  656    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3605  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  55.41 
 
 		 608 aa  647    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2893  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.72 
 
 		 604 aa  690    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2748  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.56 
 
 		 604 aa  690    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5117  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.99 
 
 		 611 aa  778    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2074  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.71 
 
 		 614 aa  650    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.666768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3931  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  56.54 
 
 		 607 aa  674    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4361  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  92.78 
 
 		 609 aa  1169    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284496  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0230  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.98 
 
 		 612 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2793  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  57.45 
 
 		 609 aa  681    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.93 
 
 		 608 aa  757    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2280  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.07 
 
 		 615 aa  665    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0733562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4086  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.51 
 
 		 609 aa  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4244  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.51 
 
 		 609 aa  865    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.517855  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1120  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  53.52 
 
 		 605 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3071  glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerising  62.85 
 
 		 611 aa  755    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  64.16 
 
 		 610 aa  771    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3499  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.93 
 
 		 612 aa  678    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4097  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.51 
 
 		 609 aa  865    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2941 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.77 
 
 		 613 aa  663    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.851914  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4198  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  68.63 
 
 		 611 aa  855    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4261  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.72 
 
 		 610 aa  864    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  62.68 
 
 		 611 aa  777    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0118  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.08 
 
 		 609 aa  677    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.101384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  62.85 
 
 		 611 aa  784    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  53.52 
 
 		 605 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  93.92 
 
 		 609 aa  1180    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3302  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  60.66 
 
 		 608 aa  722    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1692  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.89 
 
 		 617 aa  705    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0313  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.38 
 
 		 615 aa  659    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.51 
 
 		 609 aa  865    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6350  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  61.7 
 
 		 611 aa  761    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0070  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.01 
 
 		 612 aa  645    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0103  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.75 
 
 		 609 aa  674    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.03 
 
 		 610 aa  897    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 609 aa  1251    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000251004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  92.78 
 
 		 609 aa  1170    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0507  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.44 
 
 		 612 aa  675    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00435471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1501  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.66 
 
 		 605 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  74.14 
 
 		 611 aa  938    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3951  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  92.94 
 
 		 609 aa  1172    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101747  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.52 
 
 		 611 aa  647    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0675  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.86 
 
 		 616 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0208  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.65 
 
 		 605 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  91.95 
 
 		 609 aa  1166    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03557  hypothetical protein  69.51 
 
 		 609 aa  865    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.34 
 
 		 611 aa  790    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3280  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  59.74 
 
 		 610 aa  708    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  62.01 
 
 		 616 aa  790    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2397  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.03 
 
 		 614 aa  653    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0187  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.33 
 
 		 612 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.225052 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0138  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.16 
 
 		 612 aa  665    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.266568  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4070  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.51 
 
 		 609 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5165  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.34 
 
 		 609 aa  863    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212663 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0013  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing]  56.63 
 
 		 611 aa  716    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03126  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.07 
 
 		 609 aa  662    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0062  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.01 
 
 		 612 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51890  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  62.36 
 
 		 611 aa  765    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4229  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.82 
 
 		 609 aa  879    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3881  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  70.98 
 
 		 610 aa  895    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.64 
 
 		 609 aa  882    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4250  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.34 
 
 		 609 aa  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4142  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.34 
 
 		 609 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4173  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.82 
 
 		 609 aa  879    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  66.12 
 
 		 610 aa  802    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3920  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  92.94 
 
 		 609 aa  1165    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121785  normal  0.0336662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4012  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  92.78 
 
 		 609 aa  1164    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0405163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2865  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  59.84 
 
 		 610 aa  745    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4040  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  92.28 
 
 		 609 aa  1163    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.51 
 
 		 609 aa  863    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.34 
 
 		 609 aa  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1985  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  56.63 
 
 		 611 aa  717    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4199  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.82 
 
 		 609 aa  879    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118902  normal  0.122608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2890  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.1 
 
 		 605 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000354922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  61.54 
 
 		 611 aa  759    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03884  Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase  72.62 
 
 		 610 aa  904    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4564  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.72 
 
 		 610 aa  859    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  94.58 
 
 		 609 aa  1186    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4265  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.51 
 
 		 609 aa  865    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2426  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.85 
 
 		 609 aa  717    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.184466  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0095  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.24 
 
 		 620 aa  638    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  92.94 
 
 		 609 aa  1162    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3998  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  68.79 
 
 		 611 aa  836    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  92.78 
 
 		 609 aa  1170    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4136  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70 
 
 		 609 aa  870    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.89 
 
 		 610 aa  881    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  61.31 
 
 		 610 aa  785    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  91.46 
 
 		 609 aa  1152    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.07 
 
 		 611 aa  881    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  70.87 
 
 		 610 aa  895    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>