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for query gene Pecwa_4564 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03613  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  85.41 
 
 
609 aa  1079    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  85.41 
 
 
609 aa  1079    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.87 
 
 
610 aa  889    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.56 
 
 
611 aa  788    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0015  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.21 
 
 
610 aa  722    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0178  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.22 
 
 
612 aa  635    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.149941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4942  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  67.43 
 
 
610 aa  857    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.56 
 
 
609 aa  867    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.07 
 
 
609 aa  861    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5595  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  63.24 
 
 
611 aa  756    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  85.41 
 
 
609 aa  1079    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3379  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.38 
 
 
610 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2893  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.79 
 
 
604 aa  687    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2748  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.63 
 
 
604 aa  687    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5117  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  62.75 
 
 
611 aa  756    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2074  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.08 
 
 
614 aa  659    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.666768  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03557  hypothetical protein  85.41 
 
 
609 aa  1079    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0507  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.89 
 
 
612 aa  657    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00435471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51890  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  62.42 
 
 
611 aa  751    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.25 
 
 
605 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2793  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  56.51 
 
 
609 aa  664    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.72 
 
 
609 aa  859    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251004 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.22 
 
 
610 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.698391  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  68.9 
 
 
609 aa  858    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3499  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.65 
 
 
612 aa  657    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3071  glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerising  61.07 
 
 
611 aa  714    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.67 
 
 
610 aa  769    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4361  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.39 
 
 
609 aa  864    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4265  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  85.41 
 
 
609 aa  1079    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4086  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  85.25 
 
 
609 aa  1076    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5165  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  85.25 
 
 
609 aa  1077    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6331  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.25 
 
 
605 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4199  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  86.72 
 
 
609 aa  1094    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118902  normal  0.122608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3002  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.08 
 
 
605 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978616  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3050  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.38 
 
 
610 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3951  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.07 
 
 
609 aa  860    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101747  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.77 
 
 
608 aa  719    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.07 
 
 
609 aa  856    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322632 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1692  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.44 
 
 
617 aa  719    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0313  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  55.02 
 
 
615 aa  664    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2503  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.08 
 
 
605 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208753  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  61.43 
 
 
616 aa  767    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0062  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.06 
 
 
612 aa  641    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3302  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  59.25 
 
 
608 aa  696    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.85 
 
 
610 aa  904    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2242  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.38 
 
 
610 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252302  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0118  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.85 
 
 
609 aa  655    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.101384  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  86.72 
 
 
609 aa  1100    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4142  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  85.25 
 
 
609 aa  1078    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  69.23 
 
 
611 aa  870    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6350  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  62.42 
 
 
611 aa  764    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.1 
 
 
611 aa  641    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1501  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.72 
 
 
605 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0208  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.56 
 
 
605 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.39 
 
 
609 aa  867    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4250  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  84.92 
 
 
609 aa  1076    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4244  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  85.41 
 
 
609 aa  1079    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.517855  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3280  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  59.45 
 
 
610 aa  706    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4136  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  85.25 
 
 
609 aa  1078    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0361576  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2397  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.15 
 
 
614 aa  660    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4305  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.39 
 
 
609 aa  865    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.312496  hitchhiker  0.000000000243426 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0138  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.8 
 
 
612 aa  766    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.266568  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  64.22 
 
 
611 aa  793    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.38 
 
 
610 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.4 
 
 
611 aa  787    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1985  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  56.37 
 
 
611 aa  701    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  84.75 
 
 
609 aa  1075    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3998  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  89.36 
 
 
611 aa  1099    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.56 
 
 
611 aa  788    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  61.99 
 
 
610 aa  768    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3881  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  65.79 
 
 
610 aa  826    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2280  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.06 
 
 
615 aa  695    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0733562 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0013  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing]  56.21 
 
 
611 aa  701    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0103  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.85 
 
 
609 aa  655    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4173  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  86.72 
 
 
609 aa  1093    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  66.28 
 
 
610 aa  823    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3920  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.56 
 
 
609 aa  864    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121785  normal  0.0336662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4012  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.39 
 
 
609 aa  862    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0405163  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2865  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  59.9 
 
 
610 aa  721    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4040  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.21 
 
 
609 aa  867    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2426  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.94 
 
 
609 aa  691    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.184466  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3029  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.58 
 
 
605 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40621  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2977  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.25 
 
 
605 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392279  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4097  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  85.41 
 
 
609 aa  1080    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2941 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0070  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.9 
 
 
612 aa  639    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  62.42 
 
 
611 aa  764    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.542365  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.24 
 
 
611 aa  895    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03884  Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase  66.78 
 
 
610 aa  836    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.23 
 
 
609 aa  854    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664271  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4229  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  86.72 
 
 
609 aa  1094    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2890  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.9 
 
 
605 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000354922 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2042  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.38 
 
 
610 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  85.25 
 
 
609 aa  1077    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.56 
 
 
609 aa  865    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.5 
 
 
610 aa  908    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4070  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  85.25 
 
 
609 aa  1078    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0336  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.22 
 
 
610 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.56 
 
 
609 aa  867    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3728  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.9 
 
 
605 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71832  normal 
 
 
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NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.38 
 
 
609 aa  872    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
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