More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0070 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03613  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  54.38 
 
 		 609 aa  650    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.38 
 
 		 609 aa  650    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.01 
 
 		 609 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000251004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.31 
 
 		 611 aa  696    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0015  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.31 
 
 		 610 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0178  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  93.95 
 
 		 612 aa  1163    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.149941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4942  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  51.46 
 
 		 610 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.47 
 
 		 608 aa  670    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.5 
 
 		 609 aa  647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5595  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.82 
 
 		 611 aa  660    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3059  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.53 
 
 		 638 aa  750    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.229326  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3379  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  75.36 
 
 		 610 aa  941    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.79 
 
 		 611 aa  703    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5117  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.31 
 
 		 611 aa  671    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2503  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  73.86 
 
 		 605 aa  927    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3931  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  62.34 
 
 		 607 aa  759    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1232  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.93 
 
 		 631 aa  733    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409865  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0230  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  84.97 
 
 		 612 aa  1072    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  68.69 
 
 		 618 aa  870    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.442506 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2793  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  63.17 
 
 		 609 aa  754    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4173  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.55 
 
 		 609 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  75.2 
 
 		 610 aa  939    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.698391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1560  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60 
 
 		 633 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1120  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  66.99 
 
 		 605 aa  826    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3071  glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerising  55.66 
 
 		 611 aa  648    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.79 
 
 		 610 aa  672    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0336  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  75.04 
 
 		 610 aa  937    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.19 
 
 		 609 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.5 
 
 		 609 aa  653    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4463  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  67.97 
 
 		 605 aa  842    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14983  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6331  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  74.02 
 
 		 605 aa  933    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1944  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  58.79 
 
 		 607 aa  718    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.392427  normal  0.591657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2724  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  63.15 
 
 		 609 aa  798    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.98 
 
 		 611 aa  691    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.53 
 
 		 638 aa  750    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4486  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.1 
 
 		 607 aa  716    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6350  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.47 
 
 		 611 aa  673    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4199  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.55 
 
 		 609 aa  650    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118902  normal  0.122608 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0313  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  62.12 
 
 		 615 aa  763    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.62 
 
 		 610 aa  660    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1991  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  71.36 
 
 		 610 aa  883    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0348  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  66.67 
 
 		 605 aa  827    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.578101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0288  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  75.04 
 
 		 610 aa  927    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3050  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  75.36 
 
 		 610 aa  941    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4036  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.18 
 
 		 629 aa  870    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529211 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1458  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.92 
 
 		 643 aa  747    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.82 
 
 		 609 aa  655    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2740  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  66.78 
 
 		 607 aa  804    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1074  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  68.66 
 
 		 627 aa  869    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0149883  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  55.14 
 
 		 611 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  62.82 
 
 		 609 aa  785    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000225496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  60.88 
 
 		 611 aa  763    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0675  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.23 
 
 		 616 aa  881    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0208  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  74.84 
 
 		 605 aa  931    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.33 
 
 		 609 aa  649    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2042  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  75.36 
 
 		 610 aa  941    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.38 
 
 		 609 aa  650    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3280  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  56.73 
 
 		 610 aa  654    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3951  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.5 
 
 		 609 aa  651    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101747  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2977  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  74.02 
 
 		 605 aa  928    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0187  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  85.46 
 
 		 612 aa  1072    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.225052 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4244  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.38 
 
 		 609 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.517855  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.5 
 
 		 609 aa  653    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  75.36 
 
 		 610 aa  941    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.11 
 
 		 616 aa  685    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5899  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  65.17 
 
 		 639 aa  832    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0846  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  66.99 
 
 		 605 aa  834    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2368  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  74.02 
 
 		 605 aa  931    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4266  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.61 
 
 		 607 aa  726    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.46 
 
 		 610 aa  656    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3881  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  53.32 
 
 		 610 aa  653    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.73 
 
 		 610 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2759  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  63.38 
 
 		 673 aa  823    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202066  normal  0.017442 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.53 
 
 		 638 aa  750    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2242  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  75.36 
 
 		 610 aa  941    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252302  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.59 
 
 		 610 aa  635    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3920  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.33 
 
 		 609 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121785  normal  0.0336662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4012  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.33 
 
 		 609 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0405163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2865  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  56.01 
 
 		 610 aa  651    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4040  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.85 
 
 		 609 aa  644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4361  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.33 
 
 		 609 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284496  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3029  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  74.51 
 
 		 605 aa  934    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40621  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3511  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.42 
 
 		 607 aa  718    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.298041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5227  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  62.99 
 
 		 609 aa  780    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  67.32 
 
 		 605 aa  833    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.536522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.31 
 
 		 611 aa  674    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1327  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  66.99 
 
 		 605 aa  834    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2982  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  74.02 
 
 		 605 aa  931    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3445  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  63.15 
 
 		 609 aa  796    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4100  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.61 
 
 		 607 aa  726    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0641  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  68.27 
 
 		 636 aa  870    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2426  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.24 
 
 		 609 aa  643    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.184466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.85 
 
 		 609 aa  644    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.17 
 
 		 609 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0636  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.53 
 
 		 638 aa  750    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0560  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  69.97 
 
 		 619 aa  890    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.927649 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  66.83 
 
 		 605 aa  826    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4136  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.06 
 
 		 609 aa  644    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.33 
 
 		 609 aa  644    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.87 
 
 		 611 aa  669    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>