More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0889 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0889  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 469 aa  935    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118198 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1575  RND membrane fusion protein AcrA  63.66 
 
 		 448 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1757  secretion protein HlyD  63.42 
 
 		 448 aa  514  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  38.46 
 
 		 400 aa  266  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  36.05 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  37.71 
 
 		 400 aa  256  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  35.75 
 
 		 385 aa  256  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  38.66 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  36.12 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  36.12 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.89 
 
 		 385 aa  253  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  35.89 
 
 		 385 aa  253  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  35.89 
 
 		 385 aa  253  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  35.89 
 
 		 385 aa  253  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  37.99 
 
 		 397 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.99 
 
 		 397 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  37.99 
 
 		 397 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  37.99 
 
 		 397 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  37.99 
 
 		 397 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  37.99 
 
 		 397 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  37.99 
 
 		 409 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  37.99 
 
 		 409 aa  252  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  37.36 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  37.75 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  37.62 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  39.69 
 
 		 409 aa  251  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  35.65 
 
 		 385 aa  250  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  35.65 
 
 		 385 aa  250  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.61 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.15 
 
 		 395 aa  249  9e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  35.44 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  35.41 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  35.44 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  35.44 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.17 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.25 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  37.77 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  36.9 
 
 		 390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  35.66 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.93 
 
 		 422 aa  246  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.01 
 
 		 403 aa  246  6e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  36.57 
 
 		 379 aa  244  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3843  RND family efflux transporter MFP subunit  38.55 
 
 		 397 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  39.23 
 
 		 420 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  36.41 
 
 		 394 aa  242  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  39.23 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  39.23 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  35.99 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  39.23 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  39.23 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  39.23 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  39.23 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  37.29 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  34.3 
 
 		 385 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.47 
 
 		 386 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  34.3 
 
 		 385 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  34.3 
 
 		 385 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  35.85 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.92 
 
 		 396 aa  239  9e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  35.68 
 
 		 397 aa  239  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  36.78 
 
 		 442 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0579  acriflavine resistance protein A  36.17 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0884843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0517  acriflavine resistance protein A  36.17 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0520  acriflavine resistance protein A  36.17 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0763854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0536  acriflavine resistance protein A  36.17 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0526  acriflavine resistance protein A  36.17 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  35.51 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  36.78 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  33.72 
 
 		 385 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  39.32 
 
 		 420 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  37.5 
 
 		 425 aa  236  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.12 
 
 		 397 aa  236  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  35.98 
 
 		 384 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  35.85 
 
 		 386 aa  236  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  39.9 
 
 		 412 aa  236  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  35.14 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.14 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  35.14 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  35.14 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  35.14 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  35.14 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  39.9 
 
 		 412 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  35.14 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  34.81 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  35.09 
 
 		 386 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  37.74 
 
 		 385 aa  234  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  33.48 
 
 		 406 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  35.09 
 
 		 386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.99 
 
 		 384 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3911  multidrug efflux system protein MdtE  34.64 
 
 		 385 aa  233  8.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4873  multidrug efflux system protein MdtE  34.64 
 
 		 385 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  35.75 
 
 		 384 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  36.1 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.22 
 
 		 393 aa  231  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  35 
 
 		 431 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1927  multidrug efflux transport protein EefA  36.83 
 
 		 373 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000645896 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3719  RND family efflux transporter MFP subunit  36.29 
 
 		 353 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  35.32 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  34.52 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.45 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>