More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3050 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 508 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  61.88 
 
 		 510 aa  650    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 		 508 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1480  lysyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 508 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1700  lysyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 508 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  61.15 
 
 		 512 aa  656    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  62.74 
 
 		 516 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2645  lysyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 508 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.929733  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2723  lysyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 508 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1410  lysyl-tRNA synthetase  80.32 
 
 		 520 aa  841    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  61.39 
 
 		 524 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0288  lysyl-tRNA synthetase  66.35 
 
 		 514 aa  692    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0600  lysyl-tRNA synthetase  66.22 
 
 		 508 aa  681    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  60.46 
 
 		 508 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 508 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1784  lysyl-tRNA synthetase  76.27 
 
 		 520 aa  817    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  62.84 
 
 		 509 aa  655    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3620  lysyl-tRNA synthetase  89.06 
 
 		 516 aa  954    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  61.49 
 
 		 513 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  62.97 
 
 		 515 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  60.72 
 
 		 518 aa  658    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  61.11 
 
 		 508 aa  637    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  61.11 
 
 		 508 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2603  lysyl-tRNA synthetase  78.9 
 
 		 515 aa  841    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.494017  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3052  lysyl-tRNA synthetase  74.81 
 
 		 527 aa  798    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  60.38 
 
 		 514 aa  644    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 		 508 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5248  lysyl-tRNA synthetase  78.27 
 
 		 519 aa  848    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  61.11 
 
 		 508 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  60.15 
 
 		 508 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0485  lysyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 		 514 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.481097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1472  lysyl-tRNA synthetase  60.77 
 
 		 514 aa  643    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  60.19 
 
 		 514 aa  644    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1204  lysyl-tRNA synthetase  78.68 
 
 		 518 aa  852    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.325374  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3050  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 521 aa  1080    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3250  lysyl-tRNA synthetase  78.9 
 
 		 515 aa  842    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2207  lysyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 508 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  60.94 
 
 		 513 aa  629  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  61.49 
 
 		 501 aa  627  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0893  lysyl-tRNA synthetase, class-2  61.76 
 
 		 501 aa  624  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 		 507 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  57.39 
 
 		 505 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  57.2 
 
 		 505 aa  595  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  57.39 
 
 		 505 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  57.2 
 
 		 505 aa  595  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  57.2 
 
 		 505 aa  595  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  57.2 
 
 		 505 aa  595  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  57.2 
 
 		 505 aa  595  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  57.2 
 
 		 505 aa  593  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  58.07 
 
 		 505 aa  590  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  58.05 
 
 		 505 aa  590  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 505 aa  590  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  57.87 
 
 		 505 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 505 aa  587  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  57.28 
 
 		 505 aa  586  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  57.71 
 
 		 496 aa  585  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 505 aa  587  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 505 aa  587  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 505 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 505 aa  587  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 505 aa  587  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 505 aa  587  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  57.87 
 
 		 505 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  57.51 
 
 		 496 aa  583  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 505 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 505 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 505 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 505 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 505 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 		 505 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 505 aa  580  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 505 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 505 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 		 504 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 511 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 505 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  56.04 
 
 		 502 aa  560  1e-158  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  55.36 
 
 		 496 aa  556  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1060  lysyl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 499 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.175669  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  54.35 
 
 		 499 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 499 aa  555  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1496  lysyl-tRNA synthetase  55.45 
 
 		 500 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1501  lysyl-tRNA synthetase  56.67 
 
 		 500 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1101  lysyl-tRNA synthetase  55.82 
 
 		 500 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1311  lysyl-tRNA synthetase  56.67 
 
 		 500 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484413 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0983  lysyl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 496 aa  549  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3370  lysyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 505 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4226  lysyl-tRNA synthetase  55.82 
 
 		 500 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4121  lysyl-tRNA synthetase  56.02 
 
 		 500 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 505 aa  545  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 492 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2997  lysyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 502 aa  547  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 492 aa  545  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1008  lysyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 496 aa  542  1e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3428  lysyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 		 509 aa  542  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39390  lysyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 500 aa  541  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1438  lysyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 		 501 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 		 503 aa  538  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16530  lysyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 501 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 506 aa  535  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>