More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2199 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2259  MATE efflux family protein  79.34 
 
 		 455 aa  651    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2199  MATE efflux family protein  100 
 
 		 455 aa  880    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2365  MATE efflux family protein  59.33 
 
 		 458 aa  495  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.469261  normal  0.875331 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1493  MATE efflux family protein  59.11 
 
 		 458 aa  495  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2633  MATE efflux family protein  58.69 
 
 		 458 aa  489  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0913646  normal  0.0762555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4911  MATE efflux family protein  61.04 
 
 		 455 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2318  MATE efflux family protein  60.05 
 
 		 447 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5136  multi anti extrusion protein MatE  43.74 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.944792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  43.99 
 
 		 459 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1279  putative inner membrane transmembrane protein  47.76 
 
 		 459 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0284384  normal  0.285043 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6244  MATE efflux family protein  44 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.813306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1835  MATE efflux family protein  44 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  43.3 
 
 		 451 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1859  MATE efflux family protein  44 
 
 		 450 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763838  normal  0.0423968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1438  MATE efflux family protein  44.39 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.805906  hitchhiker  0.00501053 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0945  MATE efflux family protein  41.63 
 
 		 453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  43.3 
 
 		 451 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1818  MATE efflux family protein  43.18 
 
 		 459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.138431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2122  multi anti extrusion protein MatE  40.93 
 
 		 450 aa  306  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000217461  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2139  MATE efflux family protein  41.51 
 
 		 449 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000263742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2211  multidrug resistance protein NorM, putative  42.36 
 
 		 451 aa  300  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0676191  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1180  inner membrane transmembrane protein  42.89 
 
 		 448 aa  296  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000781542  normal  0.19952 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2255  MATE efflux family protein  42.53 
 
 		 451 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2383  multidrug resistance protein  42.53 
 
 		 451 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2217  MATE efflux family protein  42.53 
 
 		 451 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1862  putative multidrug resistance protein NorM  42.53 
 
 		 451 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0035  putative multidrug resistance protein NorM  42.53 
 
 		 451 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0708926  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1371  multidrug resistance protein NorM, putative  42.53 
 
 		 451 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1133  putative multidrug resistance protein NorM  42.53 
 
 		 451 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1115  MATE efflux family protein  40.81 
 
 		 448 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000487521  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1023  MATE efflux family protein  40.46 
 
 		 448 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00302987  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1311  MATE efflux family protein  39.01 
 
 		 463 aa  280  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0635  MATE efflux family protein  39.24 
 
 		 463 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3365  multi anti extrusion protein MatE  35.16 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3585  MATE efflux family protein  36.64 
 
 		 472 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  31.07 
 
 		 478 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  32.97 
 
 		 475 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  28.29 
 
 		 457 aa  177  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  32.64 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  28.44 
 
 		 453 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  28.44 
 
 		 453 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  28.25 
 
 		 454 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  28.44 
 
 		 453 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  28.44 
 
 		 453 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  28.78 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  31.71 
 
 		 457 aa  171  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  31.14 
 
 		 477 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  31.14 
 
 		 477 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  29.88 
 
 		 457 aa  170  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  29.26 
 
 		 457 aa  169  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  30.98 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  31.34 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 459 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 459 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  30.75 
 
 		 456 aa  167  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  28.82 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  30.39 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 459 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  30.91 
 
 		 459 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  32.52 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  28.82 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  28.82 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  29.45 
 
 		 459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  30.68 
 
 		 459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  26.59 
 
 		 455 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  28.93 
 
 		 457 aa  162  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  28.93 
 
 		 457 aa  162  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  28.93 
 
 		 457 aa  162  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  29.55 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  28.93 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  29.55 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  30.87 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  29.55 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  28.93 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  29.55 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  28.02 
 
 		 453 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  29.14 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  28.15 
 
 		 452 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 459 aa  161  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  27.8 
 
 		 457 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  28.15 
 
 		 452 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  27.8 
 
 		 457 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 452 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  27.8 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  27.8 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  28.11 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  26.85 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  27.8 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  27.78 
 
 		 453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  28.7 
 
 		 456 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3309  MATE efflux family protein  32.1 
 
 		 479 aa  156  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  27.86 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  30.16 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  29.63 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2429  multidrug efflux protein  29.64 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>