208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0454 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0454  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  100 
 
 		 214 aa  441  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2634  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.21 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.530594  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1905  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.83 
 
 		 182 aa  62  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3259  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.61 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667372  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3071  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.86 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1894  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.74 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1907  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.27 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0350  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.29 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0293923 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2175  RNA polymerase sigma factor  27.03 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.235427  normal  0.0685717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4471  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.99 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.368795 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0226  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.42 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2024  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.67 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00199735  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0936  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.34 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.982194 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4602  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  24.85 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1843  sigma-24 (FecI-like)  27.84 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.546319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5390  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.78 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122052  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0132  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  22.73 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00499196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0288  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.68 
 
 		 179 aa  52.4  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2575  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.41 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.239395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0466  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2171  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.41 
 
 		 271 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4866  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.43 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.644466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1092  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.73 
 
 		 173 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000530198  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3264  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.66 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1584  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.32 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3829  RNA polymerase sigma factor RpoE  27.96 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.245837  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0898  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.86 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00206828  hitchhiker  0.00000031369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1825  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.97 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6117  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.56 
 
 		 170 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1532  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.04 
 
 		 180 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0195109  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3783  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  23.68 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.374124  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0228  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.5 
 
 		 180 aa  49.3  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.9071  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0294  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.27 
 
 		 165 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.531855 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0893  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  23.33 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.3038  normal  0.0137088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5983  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.13 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0142297  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4772  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.17 
 
 		 182 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0823  sigma-24 (FecI-like)  24.56 
 
 		 199 aa  48.5  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000265534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1438  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.43 
 
 		 167 aa  48.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2776  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.16 
 
 		 173 aa  48.5  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.722977  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1471  RNA polymerase sigma factor RpoE  26.37 
 
 		 192 aa  48.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4373  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.26 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000286392  normal  0.018882 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39650  RNA polymerase, sigma subunit, ECF family  25.86 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81791  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1993  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.38 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000263841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1272  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.44 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0325871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0297  RNA polymerase sigma factor  23.7 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2697  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.62 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1400  RNA polymerase sigma factor  27.52 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.255306  hitchhiker  0.00000139495 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1465  RNA polymerase sigma factor  28.19 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.291082  hitchhiker  0.00185195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2684  RNA polymerase sigma factor  26.92 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0327308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0272  Fis family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341377  normal  0.75535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0839  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.44 
 
 		 283 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.378315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3616  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.86 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154069  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2125  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.28 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.726167  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0601  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.41 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5546  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.74 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3165  RNA polymerase sigma factor  26.32 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3096  RNA polymerase sigma factor  28.19 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2758  RNA polymerase sigma factor  25.29 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000734686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0762  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.8 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0323397 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2966  RNA polymerase sigma factor  25.29 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000101714 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2970  RNA polymerase sigma factor  25.29 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801574  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4745  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  23.67 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000041235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0545  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.44 
 
 		 175 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.54892  normal  0.0924037 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0624  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.24 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.76794 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1667  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  23.64 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0248741  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1453  RNA polymerase sigma factor  27.52 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000486459 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0563  RNA polymerase sigma factor  27.16 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0055  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.79 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1320  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.04 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2269  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.32 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1350  RNA polymerase sigma factor SigL  31.06 
 
 		 171 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2297  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.83 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0642  RNA polymerase sigma factor RpoE  26.84 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03122  RNA polymerase sigma factor  23.95 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2303  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.67 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0458  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  28.57 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1923  RNA polymerase sigma factor RpoE  29.08 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.802306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1217  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.14 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2286  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  23.6 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4716  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  22.67 
 
 		 176 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002854  RNA polymerase sigma-70 factor ECF subfamily  23.95 
 
 		 168 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1268  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.59 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00112474  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4030  RNA polymerase sigma factor  24.39 
 
 		 182 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.193201 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03970  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  22.41 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000171758  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2091  RNA polymerase sigma factor SigX  23.17 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133508  normal  0.223352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3047  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.44 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.495668  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3811  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  31.46 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1567  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  22.45 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2752  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.4 
 
 		 188 aa  45.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4484  RNA polymerase sigma factor  27.07 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1270  RNA polymerase sigma factor  26.09 
 
 		 161 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.125733  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3895  sigma-24 (FecI-like)  28.99 
 
 		 163 aa  45.1  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4573  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  23.33 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2693  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.06 
 
 		 209 aa  45.1  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0995  RNA polymerase sigma factor  24.07 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1534  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.37 
 
 		 549 aa  45.1  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2088  RNA polymerase sigma factor SigX  22.09 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.176045  normal  0.0352187 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3565  RNA polymerase sigma factor  25.16 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41575  RNA polymerase sigma factor SigX  22.42 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000797839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1826  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.15 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.184258  normal  0.243335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>