More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0552 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0552  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
331 aa  663    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00831363 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1541  ketol-acid reductoisomerase  90.83 
 
 
327 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1755  ketol-acid reductoisomerase  84.71 
 
 
328 aa  535  1e-151  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000701523 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1722  ketol-acid reductoisomerase  82.62 
 
 
328 aa  529  1e-149  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.801354  normal  0.0124349 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1168  ketol-acid reductoisomerase  67.69 
 
 
328 aa  433  1e-120  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.528024  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1641  ketol-acid reductoisomerase  60.19 
 
 
335 aa  398  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.75245  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1927  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 
335 aa  380  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  56 
 
 
333 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  56 
 
 
330 aa  365  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  54.46 
 
 
330 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  54.01 
 
 
341 aa  358  9e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  54.52 
 
 
330 aa  354  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  56 
 
 
331 aa  353  2e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  53.85 
 
 
335 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  56.31 
 
 
330 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  53.23 
 
 
329 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0873  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 
351 aa  349  3e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  53.23 
 
 
329 aa  349  4e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1189  ketol-acid reductoisomerase  55.69 
 
 
332 aa  348  6e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  52.94 
 
 
338 aa  348  6e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  53.54 
 
 
329 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  53.23 
 
 
329 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  53.56 
 
 
330 aa  347  1e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  52.62 
 
 
331 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  52.31 
 
 
331 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  53.87 
 
 
338 aa  346  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  54.8 
 
 
337 aa  346  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  52.63 
 
 
338 aa  346  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  54.26 
 
 
337 aa  345  5e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  53.7 
 
 
340 aa  345  6e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  52.01 
 
 
338 aa  345  8e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0959  ketol-acid reductoisomerase  51.2 
 
 
332 aa  344  1e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00572985 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1545  ketol-acid reductoisomerase  52 
 
 
340 aa  343  2e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159876  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  52.31 
 
 
331 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  52.62 
 
 
331 aa  343  2e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  56 
 
 
344 aa  343  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  52.01 
 
 
338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  53.7 
 
 
339 aa  342  4e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  52.63 
 
 
330 aa  342  5e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  52.31 
 
 
331 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  52.31 
 
 
331 aa  342  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  51.7 
 
 
338 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  55.69 
 
 
336 aa  340  2e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  52 
 
 
331 aa  340  2e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  52.8 
 
 
359 aa  340  2e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  51.7 
 
 
338 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  55.38 
 
 
336 aa  339  4e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2767  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 
352 aa  339  4e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  54.15 
 
 
330 aa  339  5e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0922  ketol-acid reductoisomerase  52.32 
 
 
330 aa  338  7e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  52.31 
 
 
333 aa  338  7e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  51.7 
 
 
338 aa  338  8e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  51.39 
 
 
338 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  51.39 
 
 
329 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1538  ketol-acid reductoisomerase  51.7 
 
 
330 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1680  ketol-acid reductoisomerase  52.32 
 
 
330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  56.92 
 
 
332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  51.7 
 
 
338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  52.63 
 
 
330 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  51.38 
 
 
340 aa  335  5.999999999999999e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0233  ketol-acid reductoisomerase  52.32 
 
 
330 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  51.08 
 
 
331 aa  335  7e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  53.09 
 
 
331 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  53.56 
 
 
337 aa  334  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  52.47 
 
 
342 aa  334  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 
336 aa  334  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  51.55 
 
 
327 aa  334  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  53.25 
 
 
335 aa  333  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0602  ketol-acid reductoisomerase  54.77 
 
 
330 aa  333  3e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0492028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  52.01 
 
 
338 aa  333  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1951  ketol-acid reductoisomerase  49.85 
 
 
338 aa  332  4e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  53.25 
 
 
335 aa  332  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  49.85 
 
 
338 aa  332  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  53.56 
 
 
335 aa  332  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  52.94 
 
 
335 aa  332  5e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  53.03 
 
 
337 aa  332  5e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  50.77 
 
 
338 aa  332  6e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  54.46 
 
 
331 aa  331  8e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 
338 aa  331  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  53.85 
 
 
341 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  51.71 
 
 
330 aa  330  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  55.69 
 
 
331 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  52.01 
 
 
338 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  53.85 
 
 
341 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0112  ketol-acid reductoisomerase  54.91 
 
 
332 aa  330  2e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  49.85 
 
 
338 aa  330  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1175  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 
329 aa  329  4e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.273491  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0600  ketol-acid reductoisomerase  52.27 
 
 
336 aa  329  4e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0065  ketol-acid reductoisomerase  54.77 
 
 
333 aa  329  5.0000000000000004e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000348279  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0903  ketol-acid reductoisomerase  48.92 
 
 
351 aa  328  5.0000000000000004e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  53.54 
 
 
341 aa  328  6e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4865  ketol-acid reductoisomerase  49.23 
 
 
338 aa  328  6e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  50.15 
 
 
338 aa  328  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  49.69 
 
 
339 aa  328  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  50.77 
 
 
338 aa  328  7e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1747  ketol-acid reductoisomerase  49.54 
 
 
347 aa  328  7e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0220  ketol-acid reductoisomerase  54.35 
 
 
335 aa  328  8e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22789  normal  0.0211125 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  53.54 
 
 
341 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2172  ketol-acid reductoisomerase  55.08 
 
 
329 aa  328  8e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  53.54 
 
 
341 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>