More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2144 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 337 aa  696    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  69.25 
 
 		 330 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  67.46 
 
 		 331 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  71.34 
 
 		 333 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  64.97 
 
 		 330 aa  460  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 333 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  69.25 
 
 		 330 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  66.57 
 
 		 330 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  63.28 
 
 		 331 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  63.5 
 
 		 341 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  66.47 
 
 		 331 aa  429  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  62.02 
 
 		 331 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  63.28 
 
 		 336 aa  428  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  63.5 
 
 		 344 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  63.77 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 338 aa  428  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  59.7 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  64.88 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  63.28 
 
 		 336 aa  427  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0354  ketol-acid reductoisomerase  66.97 
 
 		 341 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  63.66 
 
 		 337 aa  421  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  63.58 
 
 		 335 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  61.68 
 
 		 340 aa  423  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  62.99 
 
 		 335 aa  421  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  60.71 
 
 		 329 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  59.1 
 
 		 338 aa  417  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  59.1 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  63.5 
 
 		 335 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  59.7 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 		 331 aa  419  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  64.86 
 
 		 331 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  58.21 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 		 335 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 		 335 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 		 335 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  60.78 
 
 		 335 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 		 335 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 		 335 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_735  ketol-acid reductoisomerase  61.13 
 
 		 332 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.122769  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  57.91 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0831  ketol-acid reductoisomerase  60.83 
 
 		 332 aa  411  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.357029  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 		 335 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0750  ketol-acid reductoisomerase  60.83 
 
 		 332 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  61.45 
 
 		 327 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0602  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 		 330 aa  411  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0492028 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  64.95 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  57.61 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2984  ketol-acid reductoisomerase  60.9 
 
 		 333 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0372563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3026  ketol-acid reductoisomerase  60.9 
 
 		 333 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 336 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 336 aa  408  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  60.42 
 
 		 337 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  61.86 
 
 		 330 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 336 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 336 aa  408  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 336 aa  408  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  61.79 
 
 		 331 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  58.43 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  58.21 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  58.21 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  60.48 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  57.61 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  57.31 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  57.61 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1608  ketol-acid reductoisomerase  60.78 
 
 		 335 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000345501  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1951  ketol-acid reductoisomerase  57.01 
 
 		 338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  59.58 
 
 		 336 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0082  ketol-acid reductoisomerase  60.36 
 
 		 331 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.562426  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  59.58 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  59.58 
 
 		 336 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  57.91 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1555  ketol-acid reductoisomerase  62.28 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  56.72 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  61.49 
 
 		 331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  57.01 
 
 		 338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  58.08 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4447  ketol-acid reductoisomerase  60.78 
 
 		 337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1193  ketol-acid reductoisomerase  61.45 
 
 		 334 aa  404  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  56.72 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  56.72 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3073  ketol-acid reductoisomerase  58.51 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0220  ketol-acid reductoisomerase  61.38 
 
 		 335 aa  402  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22789  normal  0.0211125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  56.42 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  57.91 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  63.1 
 
 		 329 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 329 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  57.19 
 
 		 338 aa  401  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  56.72 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  59.28 
 
 		 329 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4865  ketol-acid reductoisomerase  57.01 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  57.91 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1966  ketol-acid reductoisomerase  61.68 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3435  ketol-acid reductoisomerase  62.5 
 
 		 331 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00388132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  56.72 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1747  ketol-acid reductoisomerase  55.82 
 
 		 347 aa  401  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 		 330 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1189  ketol-acid reductoisomerase  58.75 
 
 		 332 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  59.28 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  61.13 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>