More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1719 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  93.2 
 
 		 338 aa  649    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  95.56 
 
 		 338 aa  662    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 338 aa  694    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3324  ketol-acid reductoisomerase  89.35 
 
 		 338 aa  608  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2103  ketol-acid reductoisomerase  89.05 
 
 		 338 aa  608  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  86.39 
 
 		 338 aa  605  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  87.28 
 
 		 338 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  86.69 
 
 		 338 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  86.39 
 
 		 338 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  85.8 
 
 		 338 aa  597  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2891  ketol-acid reductoisomerase  87.87 
 
 		 338 aa  599  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0051674 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  84.91 
 
 		 338 aa  592  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  84.02 
 
 		 338 aa  592  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1951  ketol-acid reductoisomerase  84.62 
 
 		 338 aa  593  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  84.62 
 
 		 338 aa  593  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  84.62 
 
 		 338 aa  585  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1747  ketol-acid reductoisomerase  83.14 
 
 		 347 aa  585  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0751  ketol-acid reductoisomerase  84.91 
 
 		 338 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0398  ketol-acid reductoisomerase  84.91 
 
 		 338 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.422239  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1846  ketol-acid reductoisomerase  84.91 
 
 		 338 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1421  ketol-acid reductoisomerase  84.91 
 
 		 338 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5590  ketol-acid reductoisomerase  84.91 
 
 		 338 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1047  ketol-acid reductoisomerase  84.91 
 
 		 338 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00873867  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1115  ketol-acid reductoisomerase  84.91 
 
 		 338 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3229  ketol-acid reductoisomerase  84.91 
 
 		 338 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1276  ketol-acid reductoisomerase  84.91 
 
 		 338 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4865  ketol-acid reductoisomerase  80.77 
 
 		 338 aa  576  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1283  ketol-acid reductoisomerase  84.91 
 
 		 338 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2020  ketol-acid reductoisomerase  84.32 
 
 		 338 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2286  ketol-acid reductoisomerase  84.62 
 
 		 338 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1652  ketol-acid reductoisomerase  84.62 
 
 		 338 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2263  ketol-acid reductoisomerase  84.62 
 
 		 338 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1015  ketol-acid reductoisomerase  84.32 
 
 		 338 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2179  ketol-acid reductoisomerase  84.32 
 
 		 338 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1330  ketol-acid reductoisomerase  83.73 
 
 		 338 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2301  ketol-acid reductoisomerase  84.32 
 
 		 338 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0932177  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  74.26 
 
 		 338 aa  535  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3073  ketol-acid reductoisomerase  75.15 
 
 		 338 aa  531  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071293 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  73.37 
 
 		 338 aa  530  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  71.01 
 
 		 338 aa  519  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  68.93 
 
 		 338 aa  505  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  68.34 
 
 		 338 aa  504  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  68.34 
 
 		 338 aa  502  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  68.93 
 
 		 338 aa  501  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  70.41 
 
 		 338 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0524  ketol-acid reductoisomerase  68.93 
 
 		 338 aa  501  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.181387  normal  0.0101595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  69.53 
 
 		 338 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  68.93 
 
 		 338 aa  503  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  69.53 
 
 		 338 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  68.64 
 
 		 338 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  68.34 
 
 		 338 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0636  ketol-acid reductoisomerase  68.64 
 
 		 338 aa  494  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  68.64 
 
 		 338 aa  491  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  67.75 
 
 		 338 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  71.01 
 
 		 338 aa  490  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2539  ketol-acid reductoisomerase  70.71 
 
 		 338 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0383173  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  69.53 
 
 		 338 aa  488  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  69.53 
 
 		 338 aa  488  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1009  ketol-acid reductoisomerase  69.23 
 
 		 338 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0031773  hitchhiker  0.000000327544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4678  ketol-acid reductoisomerase  69.53 
 
 		 338 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0756  ketol-acid reductoisomerase  69.53 
 
 		 338 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192415  hitchhiker  0.00000148788 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0983  ketol-acid reductoisomerase  69.53 
 
 		 338 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.900438  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0611  ketol-acid reductoisomerase  68.64 
 
 		 338 aa  485  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4542  ketol-acid reductoisomerase  69.53 
 
 		 338 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0178067  hitchhiker  0.000281434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4676  ketol-acid reductoisomerase  69.53 
 
 		 338 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139972  hitchhiker  0.00000000488486 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  68.05 
 
 		 338 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0848  ketol-acid reductoisomerase  69.23 
 
 		 338 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.385412  hitchhiker  0.00438995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  68.64 
 
 		 338 aa  482  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  65.68 
 
 		 338 aa  481  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  66.27 
 
 		 336 aa  483  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0884  ketol-acid reductoisomerase  67.75 
 
 		 338 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209351  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4786  ketol-acid reductoisomerase  68.05 
 
 		 338 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  hitchhiker  0.00823723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  65.09 
 
 		 338 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  67.85 
 
 		 339 aa  475  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  67.85 
 
 		 339 aa  475  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 		 339 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  67.55 
 
 		 339 aa  471  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  67.55 
 
 		 339 aa  471  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  67.55 
 
 		 339 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  67.55 
 
 		 339 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  66.37 
 
 		 339 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  67.26 
 
 		 339 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  67.85 
 
 		 339 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  67.26 
 
 		 339 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  64.79 
 
 		 338 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  66.37 
 
 		 339 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1781  ketol-acid reductoisomerase  66.96 
 
 		 339 aa  465  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2720  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 		 339 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194376  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  66.37 
 
 		 339 aa  464  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  65.19 
 
 		 339 aa  463  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  67.06 
 
 		 339 aa  463  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  66.08 
 
 		 339 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  65.78 
 
 		 339 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  66.08 
 
 		 339 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0541  ketol-acid reductoisomerase  62.13 
 
 		 340 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1760  ketol-acid reductoisomerase  64.41 
 
 		 340 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146114  normal  0.299859 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  65.19 
 
 		 339 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2396  ketol-acid reductoisomerase  64.71 
 
 		 340 aa  455  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1238  ketol-acid reductoisomerase  65.59 
 
 		 340 aa  456  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.937598  normal  0.708924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2857  ketol-acid reductoisomerase  66.96 
 
 		 339 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>