More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3341 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  91.15 
 
 		 339 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  89.68 
 
 		 339 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  95.58 
 
 		 339 aa  674    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 339 aa  698    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  93.81 
 
 		 339 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  98.23 
 
 		 339 aa  688    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2720  ketol-acid reductoisomerase  89.97 
 
 		 339 aa  643    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194376  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  90.27 
 
 		 339 aa  632  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  89.97 
 
 		 339 aa  632  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  89.68 
 
 		 339 aa  627  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  89.38 
 
 		 339 aa  625  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  89.38 
 
 		 339 aa  625  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  88.2 
 
 		 339 aa  625  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2857  ketol-acid reductoisomerase  89.68 
 
 		 339 aa  615  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  85.55 
 
 		 339 aa  607  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  84.96 
 
 		 339 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  84.07 
 
 		 339 aa  598  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2559  ketol-acid reductoisomerase  82.01 
 
 		 339 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  77.29 
 
 		 339 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  77.88 
 
 		 339 aa  551  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  77.29 
 
 		 339 aa  548  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1781  ketol-acid reductoisomerase  76.7 
 
 		 339 aa  544  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  77.29 
 
 		 339 aa  544  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  75.81 
 
 		 339 aa  539  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2749  ketol-acid reductoisomerase  75.22 
 
 		 339 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_004310  BR1380  ketol-acid reductoisomerase  76.7 
 
 		 339 aa  535  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2778  ketol-acid reductoisomerase  75.22 
 
 		 339 aa  535  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1337  ketol-acid reductoisomerase  76.7 
 
 		 339 aa  535  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179478  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  74.93 
 
 		 339 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1813  ketol-acid reductoisomerase  76.11 
 
 		 339 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.550721  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1760  ketol-acid reductoisomerase  72.06 
 
 		 340 aa  522  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146114  normal  0.299859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2303  ketol-acid reductoisomerase  72.65 
 
 		 340 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0651  ketol-acid reductoisomerase  71.47 
 
 		 340 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261788 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0514  ketol-acid reductoisomerase  71.18 
 
 		 340 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1865  ketol-acid reductoisomerase  71.47 
 
 		 340 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1472  ketol-acid reductoisomerase  71.97 
 
 		 346 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1238  ketol-acid reductoisomerase  71.47 
 
 		 340 aa  511  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.937598  normal  0.708924 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2396  ketol-acid reductoisomerase  70.88 
 
 		 340 aa  510  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2263  ketol-acid reductoisomerase  73.45 
 
 		 339 aa  494  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  69.91 
 
 		 338 aa  488  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  69.62 
 
 		 338 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  68.44 
 
 		 338 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  67.26 
 
 		 338 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  68.73 
 
 		 338 aa  484  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  69.32 
 
 		 338 aa  487  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0917  ketol-acid reductoisomerase  67.56 
 
 		 339 aa  484  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0699462  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  69.03 
 
 		 338 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  68.73 
 
 		 338 aa  481  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  68.14 
 
 		 338 aa  483  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  67.55 
 
 		 338 aa  482  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  66.08 
 
 		 338 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  68.14 
 
 		 338 aa  482  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 		 338 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  66.08 
 
 		 338 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  65.78 
 
 		 338 aa  478  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  68.14 
 
 		 338 aa  479  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  66.08 
 
 		 338 aa  477  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3229  ketol-acid reductoisomerase  70.21 
 
 		 338 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  68.14 
 
 		 338 aa  474  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  67.26 
 
 		 338 aa  474  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5590  ketol-acid reductoisomerase  70.21 
 
 		 338 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1330  ketol-acid reductoisomerase  69.91 
 
 		 338 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  66.37 
 
 		 338 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  67.85 
 
 		 338 aa  473  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1283  ketol-acid reductoisomerase  69.62 
 
 		 338 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0398  ketol-acid reductoisomerase  69.62 
 
 		 338 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.422239  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1276  ketol-acid reductoisomerase  69.62 
 
 		 338 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1846  ketol-acid reductoisomerase  69.62 
 
 		 338 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11584  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2286  ketol-acid reductoisomerase  69.62 
 
 		 338 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1421  ketol-acid reductoisomerase  69.62 
 
 		 338 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2020  ketol-acid reductoisomerase  69.32 
 
 		 338 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2179  ketol-acid reductoisomerase  69.32 
 
 		 338 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1047  ketol-acid reductoisomerase  69.32 
 
 		 338 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00873867  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  67.55 
 
 		 338 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1115  ketol-acid reductoisomerase  69.62 
 
 		 338 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  65.49 
 
 		 338 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1652  ketol-acid reductoisomerase  69.62 
 
 		 338 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1015  ketol-acid reductoisomerase  69.62 
 
 		 338 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0751  ketol-acid reductoisomerase  69.62 
 
 		 338 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  67.26 
 
 		 338 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2301  ketol-acid reductoisomerase  69.32 
 
 		 338 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0932177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2263  ketol-acid reductoisomerase  69.62 
 
 		 338 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3073  ketol-acid reductoisomerase  66.08 
 
 		 338 aa  467  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  64.31 
 
 		 338 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  66.08 
 
 		 338 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  66.08 
 
 		 338 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  66.37 
 
 		 338 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2539  ketol-acid reductoisomerase  65.49 
 
 		 338 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0383173  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  64.6 
 
 		 338 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  67.55 
 
 		 338 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  66.37 
 
 		 338 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1747  ketol-acid reductoisomerase  64.9 
 
 		 347 aa  459  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  66.37 
 
 		 338 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4676  ketol-acid reductoisomerase  64.31 
 
 		 338 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139972  hitchhiker  0.00000000488486 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  63.42 
 
 		 338 aa  455  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4542  ketol-acid reductoisomerase  64.31 
 
 		 338 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0178067  hitchhiker  0.000281434 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0636  ketol-acid reductoisomerase  62.83 
 
 		 338 aa  457  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1009  ketol-acid reductoisomerase  64.31 
 
 		 338 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0031773  hitchhiker  0.000000327544 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  64.9 
 
 		 338 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2103  ketol-acid reductoisomerase  67.55 
 
 		 338 aa  454  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.124469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>