More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1193 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1193  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 334 aa  690    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  64.22 
 
 		 329 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  65.95 
 
 		 338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  64.35 
 
 		 338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  63.8 
 
 		 338 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  66.26 
 
 		 330 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  68.4 
 
 		 333 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 331 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 		 331 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  66.57 
 
 		 331 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 		 331 aa  432  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  65.75 
 
 		 331 aa  431  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 		 339 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 		 338 aa  431  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 		 330 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  64.85 
 
 		 331 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 		 329 aa  427  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  61.75 
 
 		 339 aa  430  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 		 338 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  61.03 
 
 		 340 aa  425  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 		 335 aa  421  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 		 335 aa  421  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 		 339 aa  421  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 		 335 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4447  ketol-acid reductoisomerase  63.86 
 
 		 337 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  60.67 
 
 		 333 aa  423  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  58.98 
 
 		 340 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  60.98 
 
 		 335 aa  418  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  59.28 
 
 		 340 aa  421  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  60.98 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 		 340 aa  418  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  60.98 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  61.96 
 
 		 327 aa  420  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  64.02 
 
 		 330 aa  418  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 		 339 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  60.98 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  60.91 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2984  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 		 333 aa  418  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0372563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3026  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 		 333 aa  418  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 		 335 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  63.19 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  62.54 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  58.68 
 
 		 340 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 331 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  64.83 
 
 		 329 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 339 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2720  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 		 339 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194376  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  59.64 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  61.45 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  63.19 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  58.38 
 
 		 340 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 339 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1966  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 		 340 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  60.98 
 
 		 335 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 		 331 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 339 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 338 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  61.63 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  62.05 
 
 		 341 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 		 339 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 		 331 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  65.24 
 
 		 333 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  56.89 
 
 		 340 aa  414  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 		 331 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 337 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 		 330 aa  410  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 		 331 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 		 339 aa  408  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  62.15 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 344 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1555  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  58.73 
 
 		 339 aa  408  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  59.64 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 		 331 aa  409  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 331 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 		 331 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  58.61 
 
 		 336 aa  408  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  64.24 
 
 		 331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 		 330 aa  404  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 		 329 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 		 331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  57.75 
 
 		 340 aa  404  1.0000000000000001e-112  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  64.24 
 
 		 331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 		 329 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  57.27 
 
 		 340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2857  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 		 339 aa  401  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658942  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2778  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 		 339 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>