More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1367 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  98.53 
 
 
340 aa  689    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  97.65 
 
 
340 aa  688    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
340 aa  699    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  87.35 
 
 
340 aa  620  1e-177  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  75.59 
 
 
340 aa  541  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  74.12 
 
 
340 aa  539  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  75.59 
 
 
340 aa  534  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  73.24 
 
 
340 aa  531  1e-150  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2003  ketol-acid reductoisomerase  72.65 
 
 
340 aa  497  1e-140  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.485925  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0541  ketol-acid reductoisomerase  68.53 
 
 
340 aa  491  9.999999999999999e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  65.09 
 
 
338 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  63.69 
 
 
336 aa  465  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  65.98 
 
 
338 aa  463  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  66.37 
 
 
339 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  65.38 
 
 
338 aa  461  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  65.09 
 
 
338 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  65.09 
 
 
338 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  64.5 
 
 
338 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  63.02 
 
 
338 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  63.02 
 
 
338 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  64.5 
 
 
338 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  63.72 
 
 
339 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  64.2 
 
 
338 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0524  ketol-acid reductoisomerase  63.02 
 
 
338 aa  454  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.181387  normal  0.0101595 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  63.61 
 
 
338 aa  455  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1472  ketol-acid reductoisomerase  65.32 
 
 
346 aa  457  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  65 
 
 
339 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  64.5 
 
 
338 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  65.35 
 
 
333 aa  457  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  64.5 
 
 
338 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  64.31 
 
 
339 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  62.43 
 
 
338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  66.27 
 
 
338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0611  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  63.02 
 
 
338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  63.02 
 
 
338 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  64.31 
 
 
339 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  64.2 
 
 
338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  63.61 
 
 
338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  62.83 
 
 
339 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  62.72 
 
 
338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  62.83 
 
 
339 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  63.42 
 
 
339 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  62.83 
 
 
339 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0983  ketol-acid reductoisomerase  63.31 
 
 
338 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.900438  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1009  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
338 aa  448  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0031773  hitchhiker  0.000000327544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0848  ketol-acid reductoisomerase  63.31 
 
 
338 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.385412  hitchhiker  0.00438995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  62.83 
 
 
339 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  62.83 
 
 
339 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  63.13 
 
 
339 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  63.31 
 
 
338 aa  448  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  62.13 
 
 
338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1813  ketol-acid reductoisomerase  65.49 
 
 
339 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.550721  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  62.13 
 
 
338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0636  ketol-acid reductoisomerase  63.02 
 
 
338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  62.83 
 
 
339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  61.65 
 
 
339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2749  ketol-acid reductoisomerase  62.94 
 
 
339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  62.72 
 
 
338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2539  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0383173  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  61.24 
 
 
338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2303  ketol-acid reductoisomerase  63.53 
 
 
340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  63.02 
 
 
338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  63.42 
 
 
339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1760  ketol-acid reductoisomerase  62.06 
 
 
340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146114  normal  0.299859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4678  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
338 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0651  ketol-acid reductoisomerase  62.06 
 
 
340 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.261788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4786  ketol-acid reductoisomerase  63.02 
 
 
338 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  hitchhiker  0.00823723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4542  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
338 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0178067  hitchhiker  0.000281434 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  61.83 
 
 
338 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 
339 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2263  ketol-acid reductoisomerase  65.78 
 
 
339 aa  441  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0756  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
338 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192415  hitchhiker  0.00000148788 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1238  ketol-acid reductoisomerase  62.06 
 
 
340 aa  444  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.937598  normal  0.708924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  61.95 
 
 
339 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2720  ketol-acid reductoisomerase  61.95 
 
 
339 aa  441  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194376  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4676  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
338 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139972  hitchhiker  0.00000000488486 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  62.54 
 
 
339 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  61.24 
 
 
338 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2778  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 
339 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0884  ketol-acid reductoisomerase  65.38 
 
 
338 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209351  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2286  ketol-acid reductoisomerase  63.31 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1846  ketol-acid reductoisomerase  63.31 
 
 
338 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11584  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  61.95 
 
 
339 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1421  ketol-acid reductoisomerase  63.31 
 
 
338 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5590  ketol-acid reductoisomerase  63.31 
 
 
338 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2020  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  60.65 
 
 
338 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3229  ketol-acid reductoisomerase  63.02 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299676  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1652  ketol-acid reductoisomerase  63.31 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  60.95 
 
 
338 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1283  ketol-acid reductoisomerase  63.31 
 
 
338 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1115  ketol-acid reductoisomerase  63.31 
 
 
338 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2263  ketol-acid reductoisomerase  63.31 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1330  ketol-acid reductoisomerase  62.72 
 
 
338 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0751  ketol-acid reductoisomerase  63.31 
 
 
338 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2103  ketol-acid reductoisomerase  63.02 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1276  ketol-acid reductoisomerase  63.31 
 
 
338 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0514  ketol-acid reductoisomerase  61.76 
 
 
340 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>