More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1905 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 333 aa  687    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  82.37 
 
 		 330 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  84.5 
 
 		 331 aa  546  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  81.46 
 
 		 329 aa  528  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  70.52 
 
 		 329 aa  498  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  72.34 
 
 		 329 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  66.47 
 
 		 338 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  69.72 
 
 		 327 aa  472  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  67.07 
 
 		 331 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  64.05 
 
 		 340 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  66.87 
 
 		 330 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  64.35 
 
 		 340 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  64.05 
 
 		 340 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  64.35 
 
 		 338 aa  463  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  64.95 
 
 		 338 aa  463  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  65.36 
 
 		 339 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  64.35 
 
 		 338 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  63.75 
 
 		 338 aa  457  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  63.75 
 
 		 338 aa  460  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  65.05 
 
 		 331 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  64.95 
 
 		 333 aa  455  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  64.46 
 
 		 339 aa  457  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  64.76 
 
 		 339 aa  455  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  65.26 
 
 		 338 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1193  ketol-acid reductoisomerase  68.4 
 
 		 334 aa  451  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 		 344 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  63.75 
 
 		 338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  69.72 
 
 		 341 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  61.63 
 
 		 340 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  64.16 
 
 		 339 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  68.6 
 
 		 331 aa  448  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  67.37 
 
 		 336 aa  449  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  63.75 
 
 		 338 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  67.17 
 
 		 337 aa  449  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  67.28 
 
 		 331 aa  450  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  63.75 
 
 		 338 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  67.47 
 
 		 341 aa  448  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 		 336 aa  447  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  66.26 
 
 		 331 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  63.55 
 
 		 339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  67.07 
 
 		 336 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  65.35 
 
 		 331 aa  444  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  67.38 
 
 		 331 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 		 331 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 		 339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  63.44 
 
 		 338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 		 338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  62.54 
 
 		 338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 		 338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  67.17 
 
 		 331 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  66.46 
 
 		 331 aa  445  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  66.87 
 
 		 335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  63.75 
 
 		 338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  66.77 
 
 		 331 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2103  ketol-acid reductoisomerase  63.75 
 
 		 338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  66.87 
 
 		 335 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  63.3 
 
 		 329 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 		 338 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  65.75 
 
 		 336 aa  441  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  66.57 
 
 		 335 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  66.57 
 
 		 335 aa  444  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 		 336 aa  442  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 		 339 aa  441  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 		 339 aa  441  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  64.65 
 
 		 338 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  65.75 
 
 		 336 aa  441  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  66.57 
 
 		 335 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 		 339 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  64.65 
 
 		 338 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1472  ketol-acid reductoisomerase  61.95 
 
 		 346 aa  443  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  66.27 
 
 		 335 aa  441  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  60.73 
 
 		 338 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 		 339 aa  441  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  66.57 
 
 		 335 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  61.33 
 
 		 340 aa  444  1e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 		 339 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  64.83 
 
 		 331 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2891  ketol-acid reductoisomerase  63.44 
 
 		 338 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0051674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  61.93 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 		 330 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  66.27 
 
 		 335 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  61.63 
 
 		 338 aa  441  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  65.44 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  65.86 
 
 		 336 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2093  ketol-acid reductoisomerase  66.56 
 
 		 334 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  62.05 
 
 		 339 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  60.42 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  60.67 
 
 		 330 aa  441  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  65.44 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 339 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  63.3 
 
 		 329 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1951  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 		 338 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  61.93 
 
 		 338 aa  437  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 		 340 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2396  ketol-acid reductoisomerase  62.76 
 
 		 340 aa  438  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2720  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 		 339 aa  437  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194376  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  62.65 
 
 		 339 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 		 338 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  65.45 
 
 		 336 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  63.3 
 
 		 329 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>