More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0387 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  98.21 
 
 
336 aa  678    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
336 aa  689    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  70.52 
 
 
333 aa  498  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  74.24 
 
 
331 aa  497  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  67.07 
 
 
331 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  67.88 
 
 
330 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 
331 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  65.96 
 
 
330 aa  464  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  67.48 
 
 
335 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  70.3 
 
 
330 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  66.77 
 
 
341 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  67.58 
 
 
330 aa  458  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  63.96 
 
 
340 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 
327 aa  455  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  65.87 
 
 
341 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  63.3 
 
 
329 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 
331 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  63.77 
 
 
340 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  63.64 
 
 
338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 
331 aa  452  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0831  ketol-acid reductoisomerase  65.56 
 
 
332 aa  449  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.357029  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  69.21 
 
 
330 aa  449  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  65.56 
 
 
331 aa  451  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  62.58 
 
 
338 aa  448  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  63.19 
 
 
338 aa  449  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  62.28 
 
 
340 aa  448  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  62.57 
 
 
340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  62.28 
 
 
340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  64.16 
 
 
344 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  64.95 
 
 
336 aa  441  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  64.44 
 
 
331 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  61.68 
 
 
338 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  61.56 
 
 
338 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 
338 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 
340 aa  442  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_735  ketol-acid reductoisomerase  64.05 
 
 
332 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.122769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  64.05 
 
 
336 aa  441  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  63.36 
 
 
342 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  61.38 
 
 
338 aa  441  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0750  ketol-acid reductoisomerase  64.35 
 
 
332 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  64.95 
 
 
336 aa  441  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  64.44 
 
 
331 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  61.56 
 
 
338 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 
340 aa  443  1e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  67.37 
 
 
333 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  64.65 
 
 
336 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  64.65 
 
 
336 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  63.75 
 
 
331 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  64.65 
 
 
336 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  63.99 
 
 
341 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0354  ketol-acid reductoisomerase  67.89 
 
 
341 aa  438  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 
331 aa  438  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  62.77 
 
 
338 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  64.65 
 
 
336 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  61.79 
 
 
339 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  63.99 
 
 
341 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  64.35 
 
 
336 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  66.97 
 
 
333 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  64.65 
 
 
336 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  63.99 
 
 
341 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
331 aa  437  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  63.28 
 
 
337 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  61.23 
 
 
336 aa  438  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  61.83 
 
 
340 aa  438  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0065  ketol-acid reductoisomerase  64.86 
 
 
333 aa  436  1e-121  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000348279  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  63.64 
 
 
338 aa  434  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
338 aa  435  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  66.07 
 
 
332 aa  436  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1846  ketol-acid reductoisomerase  61.86 
 
 
338 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11584  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  60.96 
 
 
338 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  60.66 
 
 
338 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1421  ketol-acid reductoisomerase  61.86 
 
 
338 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0398  ketol-acid reductoisomerase  61.86 
 
 
338 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.422239  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1555  ketol-acid reductoisomerase  63.96 
 
 
340 aa  435  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 
331 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 
338 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1047  ketol-acid reductoisomerase  61.86 
 
 
338 aa  434  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00873867  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0751  ketol-acid reductoisomerase  61.86 
 
 
338 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  63.39 
 
 
337 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1115  ketol-acid reductoisomerase  61.86 
 
 
338 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  63.75 
 
 
336 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  64.26 
 
 
336 aa  435  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  64.05 
 
 
336 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  61.26 
 
 
338 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1276  ketol-acid reductoisomerase  61.86 
 
 
338 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1283  ketol-acid reductoisomerase  61.86 
 
 
338 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  67.07 
 
 
331 aa  431  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1966  ketol-acid reductoisomerase  63.96 
 
 
340 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  67.07 
 
 
331 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2020  ketol-acid reductoisomerase  62.16 
 
 
338 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  60.96 
 
 
338 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  62.76 
 
 
338 aa  432  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1189  ketol-acid reductoisomerase  63.75 
 
 
332 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 
338 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0873  ketol-acid reductoisomerase  61.35 
 
 
351 aa  434  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  61.96 
 
 
331 aa  431  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2179  ketol-acid reductoisomerase  61.56 
 
 
338 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956116  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3229  ketol-acid reductoisomerase  61.86 
 
 
338 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299676  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  61.35 
 
 
339 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  64.2 
 
 
335 aa  431  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>