More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2484 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
333 aa  687    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  74.85 
 
 
330 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  75.76 
 
 
331 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  71.34 
 
 
337 aa  487  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  68.39 
 
 
333 aa  482  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  71.04 
 
 
344 aa  481  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  67.78 
 
 
330 aa  480  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  71.21 
 
 
331 aa  475  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  68.48 
 
 
331 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  68.48 
 
 
330 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  72.73 
 
 
330 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  69.3 
 
 
341 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  68.81 
 
 
327 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0354  ketol-acid reductoisomerase  71.87 
 
 
341 aa  462  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  68.79 
 
 
341 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  67.17 
 
 
337 aa  457  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3435  ketol-acid reductoisomerase  69.49 
 
 
331 aa  457  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00388132  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  67.58 
 
 
331 aa  459  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  65.55 
 
 
338 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  68.48 
 
 
331 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  66.77 
 
 
335 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  66.77 
 
 
335 aa  456  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  69.82 
 
 
331 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  65.34 
 
 
338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  66.16 
 
 
335 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  65.34 
 
 
338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  69.51 
 
 
329 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  65.55 
 
 
329 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  66.16 
 
 
335 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  66.97 
 
 
336 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  63.72 
 
 
338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  66.97 
 
 
336 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  65.86 
 
 
335 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  66.16 
 
 
335 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  65.65 
 
 
331 aa  451  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  65.05 
 
 
331 aa  450  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  65.86 
 
 
335 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  65.05 
 
 
331 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  67.38 
 
 
330 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  65.86 
 
 
335 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 
338 aa  451  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  65.26 
 
 
335 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  64.74 
 
 
331 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  63.61 
 
 
338 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 
340 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 
331 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  62.8 
 
 
338 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  65.05 
 
 
331 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  69 
 
 
331 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  64.24 
 
 
336 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  63.8 
 
 
330 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  69.63 
 
 
330 aa  438  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0602  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 
330 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0492028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  69 
 
 
331 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 
331 aa  440  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
338 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  65.35 
 
 
331 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  64.44 
 
 
336 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  64.44 
 
 
336 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  64.42 
 
 
330 aa  435  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  64.42 
 
 
338 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2218  ketol-acid reductoisomerase  66.16 
 
 
331 aa  435  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  63.22 
 
 
331 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  67.07 
 
 
333 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  64.42 
 
 
338 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  63.22 
 
 
342 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1966  ketol-acid reductoisomerase  63.8 
 
 
340 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 
336 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 
336 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 
338 aa  431  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  64.13 
 
 
336 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 
336 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 
338 aa  432  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 
336 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0708  ketol-acid reductoisomerase  67.78 
 
 
335 aa  432  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
339 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1555  ketol-acid reductoisomerase  63.5 
 
 
340 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
339 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 
336 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 
336 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 
336 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 
329 aa  430  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0220  ketol-acid reductoisomerase  63.64 
 
 
335 aa  428  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22789  normal  0.0211125 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  63.22 
 
 
336 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 
329 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
339 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  60.67 
 
 
338 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 
340 aa  428  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 
338 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
329 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  62.8 
 
 
330 aa  428  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
329 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2984  ketol-acid reductoisomerase  64.72 
 
 
333 aa  428  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0372563  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3026  ketol-acid reductoisomerase  64.72 
 
 
333 aa  428  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  65.85 
 
 
332 aa  428  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0481  ketol-acid reductoisomerase  64.85 
 
 
329 aa  425  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.495995  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
339 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  62.73 
 
 
341 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
339 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2172  ketol-acid reductoisomerase  65.15 
 
 
329 aa  425  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>