More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0708 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0708  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
335 aa  687    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0220  ketol-acid reductoisomerase  73.73 
 
 
335 aa  508  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22789  normal  0.0211125 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  65.76 
 
 
330 aa  461  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  62.73 
 
 
330 aa  446  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  64.05 
 
 
331 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  67.78 
 
 
333 aa  434  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 
330 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
338 aa  431  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
331 aa  424  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  62.28 
 
 
337 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 
338 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 
338 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 
338 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1951  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 
338 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 
338 aa  419  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 
338 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  61.96 
 
 
327 aa  421  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 
338 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 
338 aa  418  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0524  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 
338 aa  420  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.181387  normal  0.0101595 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0873  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 
351 aa  419  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 
338 aa  418  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 
338 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 
338 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0112  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 
332 aa  418  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1747  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 
347 aa  415  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0983  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.900438  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0636  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
338 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  61.66 
 
 
331 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 
338 aa  415  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
340 aa  413  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0848  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 
338 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.385412  hitchhiker  0.00438995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3073  ketol-acid reductoisomerase  59.33 
 
 
338 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0071293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 
331 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4786  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 
338 aa  411  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  hitchhiker  0.00823723 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 
331 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 
338 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 
338 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4676  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
338 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139972  hitchhiker  0.00000000488486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4678  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
338 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0756  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 
338 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192415  hitchhiker  0.00000148788 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0354  ketol-acid reductoisomerase  65.15 
 
 
341 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 
338 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  57.8 
 
 
338 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4542  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
338 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0178067  hitchhiker  0.000281434 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2103  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 
338 aa  408  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 
338 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4865  ketol-acid reductoisomerase  57.93 
 
 
338 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1009  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 
338 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0031773  hitchhiker  0.000000327544 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 
338 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0611  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 
338 aa  408  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  59.1 
 
 
339 aa  410  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 
336 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 
338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  63.53 
 
 
330 aa  404  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2539  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0383173  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  61.33 
 
 
344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 
338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 
330 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0884  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 
338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2891  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 
338 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0051674 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
336 aa  401  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2767  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 
352 aa  404  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 
330 aa  404  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  56.84 
 
 
338 aa  401  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  60.67 
 
 
329 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 
338 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  57.93 
 
 
329 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0233  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 
330 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1680  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 
330 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 
330 aa  402  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0903  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 
351 aa  401  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  60.42 
 
 
331 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  57.75 
 
 
340 aa  398  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 
341 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1538  ketol-acid reductoisomerase  59.44 
 
 
330 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 
338 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  57.8 
 
 
338 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  58.95 
 
 
330 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0922  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 
330 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  57.14 
 
 
338 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  57.14 
 
 
333 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 
338 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  56.5 
 
 
330 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  59.33 
 
 
338 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 
338 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 
331 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 
330 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 
337 aa  395  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 
338 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  56.8 
 
 
335 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  58.18 
 
 
330 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 
338 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  58.68 
 
 
341 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2654  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 
344 aa  397  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  58.26 
 
 
336 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>